21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0933 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0933  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 456 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  55.63 
 
 		 387 aa  143  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0528  hypothetical protein  53.68 
 
 		 164 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3809  ANTAR domain protein with unknown sensor  57.46 
 
 		 162 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4234  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.97 
 
 		 198 aa  81.3  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.31 
 
 		 196 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.13 
 
 		 196 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.92 
 
 		 194 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  31.88 
 
 		 265 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  43.08 
 
 		 194 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3622  PAS sensor protein  34.25 
 
 		 684 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  32.18 
 
 		 238 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  36 
 
 		 268 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 		 684 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  34.78 
 
 		 255 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  46.15 
 
 		 248 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  44.26 
 
 		 235 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  45.28 
 
 		 252 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.38 
 
 		 198 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.26 
 
 		 270 aa  43.9  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.04 
 
 		 266 aa  43.1  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>