33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3794 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 387 aa  727    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0933  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54.07 
 
 		 456 aa  348  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3809  ANTAR domain protein with unknown sensor  59.42 
 
 		 162 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0043298 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0528  hypothetical protein  51.75 
 
 		 164 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4234  ANTAR domain protein with unknown sensor  43.94 
 
 		 198 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  32.18 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  47.62 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.54 
 
 		 268 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.33 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  51.79 
 
 		 248 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  45.28 
 
 		 235 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  46.03 
 
 		 265 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.84 
 
 		 196 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.85 
 
 		 194 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  39.68 
 
 		 194 aa  46.6  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.33 
 
 		 198 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.71 
 
 		 270 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1599  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.45 
 
 		 343 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.19 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  45.28 
 
 		 252 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  35.09 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1401  putative PAS/PAC sensor protein  40.3 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  35.09 
 
 		 264 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.55 
 
 		 227 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.55 
 
 		 227 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.55 
 
 		 227 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  43.4 
 
 		 260 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  45.76 
 
 		 258 aa  43.1  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5619  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.28 
 
 		 236 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.644035  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.04 
 
 		 266 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.28 
 
 		 249 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.28 
 
 		 249 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.74 
 
 		 266 aa  43.1  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>