107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1310 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  100 
 
 		 254 aa  484  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.79 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.72 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  33.19 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.53 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.4 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.53 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.32 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  38.6 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.24 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.45 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.79 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.46 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.12 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.6 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.39 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.39 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.39 
 
 		 227 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.21 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.66 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  36.13 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.61 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.66 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.66 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.01 
 
 		 235 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.55 
 
 		 228 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  40 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  32.72 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.78 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.35 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  31.08 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.43 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.77 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.85 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.88 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.13 
 
 		 279 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  32.66 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  32.66 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.58 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  30 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.98 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  33.33 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.27 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.6 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.36 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.57 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.58 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.58 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  32.72 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.94 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.74 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.42 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.39 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  35.32 
 
 		 417 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  29.59 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.11 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  35.1 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  33.33 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  31.93 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  32.72 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.95 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  32.92 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  31.65 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  31.65 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  29.45 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.2 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.29 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.01 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2264  putative GAF sensor protein  30.23 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.59 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.89 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  33.12 
 
 		 252 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  54.55 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  54.55 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  54.55 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.11 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.28 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.28 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  48.94 
 
 		 203 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 		 906 aa  48.9  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0261  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.38 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0271  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.38 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  28.24 
 
 		 405 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.8 
 
 		 246 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.82 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  28.3 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.54 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0560  putative PAS/PAC sensor protein  41.82 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  29.65 
 
 		 251 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  31.63 
 
 		 1629 aa  45.8  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3428  ANTAR domain protein  43.94 
 
 		 93 aa  45.8  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1127  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.71 
 
 		 989 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0382  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.89 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  29.92 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.32 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.03 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 1135 aa  43.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  31.4 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>