28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3428 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3428  ANTAR domain protein  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  50.98 
 
 		 246 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  48.28 
 
 		 248 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.77 
 
 		 236 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  44.26 
 
 		 250 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  42.37 
 
 		 268 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.06 
 
 		 249 aa  47.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5111  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.23 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  43.33 
 
 		 245 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.59 
 
 		 227 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  41.67 
 
 		 246 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.17 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.59 
 
 		 227 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.59 
 
 		 227 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  42.31 
 
 		 264 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  42.31 
 
 		 259 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  54.76 
 
 		 254 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.45 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.67 
 
 		 245 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.84 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.67 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  37.93 
 
 		 225 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  45.83 
 
 		 246 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  51.28 
 
 		 265 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0528  hypothetical protein  37.1 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.51 
 
 		 262 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.62 
 
 		 256 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>