60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0262 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.22 
 
 
255 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.22 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  30.61 
 
 
246 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.83 
 
 
247 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.41 
 
 
245 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  28.37 
 
 
245 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.77 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  29.51 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  30.52 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.6 
 
 
250 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.27 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.88 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  28.42 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.85 
 
 
268 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.25 
 
 
242 aa  63.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.78 
 
 
239 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  25.79 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.71 
 
 
243 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  24.04 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.5 
 
 
236 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  32.14 
 
 
252 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.54 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  24.62 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.12 
 
 
246 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.46 
 
 
270 aa  57.4  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  30.94 
 
 
240 aa  55.8  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.39 
 
 
245 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  35.05 
 
 
246 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  32.47 
 
 
251 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  36.05 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  29.41 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  25.14 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.89 
 
 
228 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.75 
 
 
235 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  30.09 
 
 
1629 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4108  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
1095 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.8 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.27 
 
 
249 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  30.51 
 
 
260 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.55 
 
 
244 aa  45.8  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.95 
 
 
253 aa  45.4  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.59 
 
 
227 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.59 
 
 
227 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.67 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5220  putative GAF sensor protein  31.25 
 
 
235 aa  44.3  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.59 
 
 
227 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 
702 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  30.68 
 
 
234 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.53 
 
 
266 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  23.11 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  30.67 
 
 
245 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.09 
 
 
265 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.28 
 
 
248 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  25.44 
 
 
276 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.95 
 
 
302 aa  42.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  24.58 
 
 
249 aa  42.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  31.65 
 
 
252 aa  42.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>