219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2319 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 		 206 aa  400  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  81.25 
 
 		 208 aa  331  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  78.37 
 
 		 208 aa  311  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1415  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  74.63 
 
 		 210 aa  305  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609776  normal  0.778661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3266  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  72.33 
 
 		 210 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  71.16 
 
 		 215 aa  295  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  68.29 
 
 		 210 aa  276  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0382  response regulator transcription regulator protein  56.21 
 
 		 195 aa  196  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0259  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.85 
 
 		 212 aa  187  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0238  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.25 
 
 		 212 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  50.89 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0278  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50.89 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  49.13 
 
 		 191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.7 
 
 		 191 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.85 
 
 		 191 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  43.41 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.06 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1759  response regulator/ANTAR domain-containing protein  45.88 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  45.88 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2271  response regulator receiver domain-containing protein  48.57 
 
 		 188 aa  151  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  45.88 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  45.88 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  45.88 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  45.88 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  45.88 
 
 		 198 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  43.93 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  44.44 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  45.45 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.89 
 
 		 192 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.7 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.86 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  43.43 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  42.86 
 
 		 191 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  46.02 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  46.02 
 
 		 192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  43.43 
 
 		 191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1167  response regulator NasT  44.71 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136185  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.57 
 
 		 221 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.57 
 
 		 195 aa  145  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.57 
 
 		 194 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.4 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50.7 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.06 
 
 		 206 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.81 
 
 		 196 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.54 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1762  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.11 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.81 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.4 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.4 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  42.54 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.58 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  42.78 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.26 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50.7 
 
 		 198 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.01 
 
 		 196 aa  141  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.18 
 
 		 195 aa  141  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.25 
 
 		 195 aa  141  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.39 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4403  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.4 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.71 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.29 
 
 		 191 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.52 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.71 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.33 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.14 
 
 		 191 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.21 
 
 		 193 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  35.71 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.29 
 
 		 192 aa  131  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2529  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.1 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2973  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.72 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.11 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.33 
 
 		 202 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3768  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.59 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.5 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.79 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.27 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.61 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.59 
 
 		 430 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.93 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.29 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.17 
 
 		 383 aa  99.8  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  34.25 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.19 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  39.16 
 
 		 204 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1968  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.21 
 
 		 193 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.59 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  34.34 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  35.76 
 
 		 426 aa  92.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.73 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.73 
 
 		 229 aa  91.7  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.97 
 
 		 206 aa  91.7  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.09 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  36.97 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  35.15 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.93 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.93 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.93 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.62 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.5 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>