More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2581 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  94.27 
 
 		 192 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  93.19 
 
 		 191 aa  358  4e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  91.15 
 
 		 192 aa  354  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  90.1 
 
 		 192 aa  354  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  92.15 
 
 		 191 aa  352  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  92.15 
 
 		 191 aa  352  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  85.86 
 
 		 191 aa  328  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  85.86 
 
 		 191 aa  327  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  84.29 
 
 		 191 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  84.29 
 
 		 191 aa  325  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  43.55 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  43.55 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  43.55 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  43.55 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1759  response regulator/ANTAR domain-containing protein  43.55 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  43.55 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  43.55 
 
 		 198 aa  171  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  44.04 
 
 		 191 aa  168  4e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.26 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.39 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1167  response regulator NasT  41.94 
 
 		 198 aa  164  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136185  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4403  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.85 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.72 
 
 		 198 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.96 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.17 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.72 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.72 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.63 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  43.16 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.16 
 
 		 191 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  43.81 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40 
 
 		 224 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.16 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0278  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.25 
 
 		 219 aa  154  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.29 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.43 
 
 		 196 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  42.94 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.89 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1762  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.95 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.89 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0259  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.11 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.68 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.22 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.33 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0238  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.57 
 
 		 212 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.22 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  39.78 
 
 		 195 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.31 
 
 		 215 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.15 
 
 		 194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0382  response regulator transcription regulator protein  42.26 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.56 
 
 		 202 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2271  response regulator receiver domain-containing protein  42.08 
 
 		 188 aa  144  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.46 
 
 		 195 aa  144  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1415  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.71 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609776  normal  0.778661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  39.68 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.56 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.62 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.27 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3266  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.57 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2529  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.46 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.1 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.62 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  40.93 
 
 		 195 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.98 
 
 		 196 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.44 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  34.55 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.86 
 
 		 192 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.79 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.51 
 
 		 202 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2973  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.99 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3768  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.7 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.22 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.89 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.61 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.16 
 
 		 196 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.26 
 
 		 430 aa  99  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.64 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.89 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1968  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.25 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.53 
 
 		 198 aa  89.4  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.88 
 
 		 383 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  34.21 
 
 		 426 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.8 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.28 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2590  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.42 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012524 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  29.27 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.11 
 
 		 210 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.11 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.11 
 
 		 210 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.68 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.2 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  30.39 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  27.57 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  31.52 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.4 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.1 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  26.59 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.93 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>