227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0769 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  34.95 
 
 		 191 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  34.64 
 
 		 191 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.51 
 
 		 195 aa  122  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.15 
 
 		 196 aa  121  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  36.81 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1415  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.58 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609776  normal  0.778661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3266  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  33.72 
 
 		 210 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2529  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.43 
 
 		 212 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.5 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.5 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.61 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  32.07 
 
 		 192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  31.58 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  32.07 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.43 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  35.33 
 
 		 194 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.81 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0278  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.15 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  32.07 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.61 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  32.07 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.94 
 
 		 196 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  30.98 
 
 		 195 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.74 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  31.61 
 
 		 195 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.03 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.43 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0382  response regulator transcription regulator protein  32.37 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.11 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.57 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.61 
 
 		 202 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.61 
 
 		 195 aa  106  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  31.52 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  31.52 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  31.52 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  31.52 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1759  response regulator/ANTAR domain-containing protein  31.52 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  31.52 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  31.52 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1167  response regulator NasT  31.52 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  30.43 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.24 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  30.43 
 
 		 192 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.03 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.43 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.84 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.89 
 
 		 191 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.05 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.69 
 
 		 198 aa  101  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.87 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.87 
 
 		 219 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.49 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.07 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4403  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.42 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0259  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.48 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.15 
 
 		 198 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0238  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.9 
 
 		 212 aa  99  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.8 
 
 		 191 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.8 
 
 		 191 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.22 
 
 		 194 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2973  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.39 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.67 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.35 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.84 
 
 		 202 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1762  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.62 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1132  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.69 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.169793  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.04 
 
 		 193 aa  91.7  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 430 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.94 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.28 
 
 		 210 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.5 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.5 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  40.71 
 
 		 187 aa  88.2  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.27 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  28.73 
 
 		 426 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.47 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.61 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.42 
 
 		 194 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.65 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.65 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.47 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1968  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.17 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.62 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.08 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  30.89 
 
 		 206 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.92 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.03 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  25 
 
 		 191 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  27.86 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2271  response regulator receiver domain-containing protein  35.85 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.37 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3768  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.12 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.84 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.91 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>