80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1090 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1090  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 228 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5727  putative PAS/PAC sensor protein  69.16 
 
 		 225 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5202  putative PAS/PAC sensor protein  51.56 
 
 		 223 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5493  putative PAS/PAC sensor protein  51.56 
 
 		 223 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5113  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  51.56 
 
 		 223 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  50.25 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  50.25 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  50.25 
 
 		 222 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4425  putative PAS/PAC sensor protein  46.12 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3447  putative PAS/PAC sensor protein  47.78 
 
 		 199 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.509002  normal  0.758938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  43.06 
 
 		 238 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  40.11 
 
 		 340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1643  putative PAS/PAC sensor protein  45.31 
 
 		 145 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1618  PAS fold-3  45.31 
 
 		 145 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11970  RNA-binding protein with PAS domain  34.67 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.494422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1401  putative PAS/PAC sensor protein  38.12 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0100  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.59 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1589  putative PAS/PAC sensor protein  49.48 
 
 		 144 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  31.47 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3029  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 274 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3244  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1403  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.33 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.478088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  31.69 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0560  putative PAS/PAC sensor protein  27.81 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1288  sensory box protein  27.97 
 
 		 685 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 1669 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 1300 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3030  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.08 
 
 		 1596 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.010791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1313  PAS sensor protein  27.12 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.61 
 
 		 958 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4878  PAS fold-3 domain protein  35.71 
 
 		 142 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.5 
 
 		 785 aa  48.9  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  48.08 
 
 		 270 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1965 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 1116 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.44 
 
 		 1148 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  27.52 
 
 		 2303 aa  47.8  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.77 
 
 		 1070 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0732  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.09 
 
 		 446 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  28.16 
 
 		 1089 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  55.56 
 
 		 302 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.55 
 
 		 865 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.19 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 986 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  45.83 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  50 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.08 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.64 
 
 		 572 aa  45.1  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 712 aa  45.1  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.44 
 
 		 954 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  23.14 
 
 		 547 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 1273 aa  44.7  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.9 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.13 
 
 		 1514 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  26.96 
 
 		 2272 aa  44.3  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.13 
 
 		 1514 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.68 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  28.44 
 
 		 914 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 1562 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 2693 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1303  transcriptional regulator, LuxR family  25.69 
 
 		 442 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0193  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  21.52 
 
 		 924 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0289682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1182 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  44.83 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.81 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.5 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3508  diguanylate cyclase  37.25 
 
 		 358 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00123099  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 1047 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 		 1432 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.38 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0913  putative PAS/PAC sensor protein  34.44 
 
 		 428 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0844  putative PAS/PAC sensor protein  34.44 
 
 		 428 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0207923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 1202 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  41.54 
 
 		 250 aa  42  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 695 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>