144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3447 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3447  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
199 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.509002  normal  0.758938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5184  putative PAS/PAC sensor protein  49.74 
 
 
222 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5273  putative PAS/PAC sensor protein  49.74 
 
 
222 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5565  putative PAS/PAC sensor protein  49.74 
 
 
222 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5727  putative PAS/PAC sensor protein  52.02 
 
 
225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4425  putative PAS/PAC sensor protein  48.48 
 
 
235 aa  194  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1090  putative PAS/PAC sensor protein  47.78 
 
 
228 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0873  PAS fold-3 domain protein  46.19 
 
 
238 aa  174  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.637627  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5113  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.5 
 
 
223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5202  putative PAS/PAC sensor protein  48.5 
 
 
223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5493  putative PAS/PAC sensor protein  48.5 
 
 
223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2088  putative PAS/PAC sensor protein  38.54 
 
 
340 aa  149  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00176198  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11970  RNA-binding protein with PAS domain  41.81 
 
 
247 aa  141  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.494422  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1401  putative PAS/PAC sensor protein  36.69 
 
 
216 aa  119  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.495161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0100  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.94 
 
 
241 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3029  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
274 aa  97.8  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.546603 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3244  putative PAS/PAC sensor protein  33.76 
 
 
229 aa  94.4  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3293  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
203 aa  92.8  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1618  PAS fold-3  45.63 
 
 
145 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1643  putative PAS/PAC sensor protein  45.63 
 
 
145 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1589  putative PAS/PAC sensor protein  45.63 
 
 
144 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500072  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4361  putative PAS/PAC sensor protein  31.64 
 
 
365 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.16012  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 
1965 aa  71.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0560  putative PAS/PAC sensor protein  26.63 
 
 
244 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1403  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.46 
 
 
235 aa  61.6  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.478088  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2564  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  26.28 
 
 
1089 aa  58.9  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
1562 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
921 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
2693 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.57 
 
 
954 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0732  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.52 
 
 
446 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 
1002 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4878  PAS fold-3 domain protein  30.95 
 
 
142 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0193  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.82 
 
 
924 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0289682  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  26.21 
 
 
2303 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1288  sensory box protein  23.08 
 
 
685 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.538668  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3508  diguanylate cyclase  29.52 
 
 
358 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00123099  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0471  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.08 
 
 
572 aa  52.4  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.634401  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  25.99 
 
 
1041 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 
1016 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2380  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.19 
 
 
1070 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  25.37 
 
 
499 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  27.2 
 
 
872 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1990  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.04 
 
 
958 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
1669 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2876  sensory transduction histidine kinase  28.57 
 
 
936 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.558657 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
1273 aa  49.3  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  51.06 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  27.62 
 
 
2279 aa  49.7  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
1051 aa  49.3  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  36.26 
 
 
1047 aa  49.3  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
1253 aa  49.3  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 
897 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5882  PAS domain-containing protein  33.65 
 
 
202 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.683919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
1808 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
3706 aa  48.5  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
1676 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
1004 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 
1069 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  25.47 
 
 
1629 aa  48.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3414  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 
673 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46 
 
 
246 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 
915 aa  47.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6994  putative PAS/PAC sensor protein  31.96 
 
 
797 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  21.37 
 
 
547 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 
1432 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
713 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 
823 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.11093  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.1 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
626 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
1148 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  53.49 
 
 
241 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 
1009 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 
1116 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0364  PAS sensor protein  30.11 
 
 
501 aa  45.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2750  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.71 
 
 
637 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.944283  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0529  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 
575 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
785 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
657 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  41.38 
 
 
417 aa  45.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 
1300 aa  45.4  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.17 
 
 
707 aa  45.1  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50 
 
 
266 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6278  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.73 
 
 
1064 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.719663  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.74 
 
 
268 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.53 
 
 
1514 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3393  putative PAS/PAC sensor protein  22.67 
 
 
545 aa  45.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
512 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.53 
 
 
1514 aa  45.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.77 
 
 
696 aa  44.7  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0252232  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
712 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.338238 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 
918 aa  43.9  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
1124 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.781779 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
1191 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
665 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2810  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.85 
 
 
998 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
1171 aa  43.5  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 
896 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>