More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1508 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  100 
 
 		 178 aa  359  9e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  51.76 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  49.09 
 
 		 165 aa  175  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  44.57 
 
 		 174 aa  171  5.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  49.7 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  46.15 
 
 		 169 aa  168  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  48.82 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  45.56 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  45.51 
 
 		 168 aa  166  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  45.29 
 
 		 169 aa  164  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  44 
 
 		 174 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  48.84 
 
 		 181 aa  160  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  48.26 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  45.96 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  47.67 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  45.93 
 
 		 181 aa  157  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  46.47 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  42.42 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  45.4 
 
 		 169 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  46.47 
 
 		 197 aa  144  8.000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  41.42 
 
 		 179 aa  142  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  40.24 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  38.18 
 
 		 176 aa  141  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  43.9 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  39.89 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  37.13 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  43.45 
 
 		 179 aa  135  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  42.86 
 
 		 179 aa  134  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  41.04 
 
 		 177 aa  131  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  43.71 
 
 		 179 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  41.67 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  35.47 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  40.12 
 
 		 174 aa  127  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  42.14 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  46.46 
 
 		 180 aa  91.3  7e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  45.31 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  37.5 
 
 		 180 aa  89.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  31.76 
 
 		 187 aa  88.2  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  38.73 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  37.14 
 
 		 181 aa  87.8  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 		 188 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  40.16 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  40.85 
 
 		 184 aa  87  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  40.16 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  38.58 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  42.96 
 
 		 189 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  42.52 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  36.17 
 
 		 188 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  38.57 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  40.16 
 
 		 180 aa  86.3  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  40.85 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  40.8 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0421  50S ribosomal protein L5  40.74 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.889596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  36.17 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  37.96 
 
 		 182 aa  85.5  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 197 aa  85.1  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0463  50S ribosomal protein L5  39.2 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153089  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  42.75 
 
 		 187 aa  85.1  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  39.37 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  37.24 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0278  50S ribosomal protein L5  34.75 
 
 		 177 aa  85.1  5e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000073879  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0600  50S ribosomal protein L5  40 
 
 		 177 aa  84.7  6e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0797735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  40.94 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  40.16 
 
 		 185 aa  84.3  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  39.74 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  38.81 
 
 		 243 aa  84.3  8e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  39.74 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  39.74 
 
 		 179 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  41.1 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0486  50S ribosomal protein L5  39.31 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000104072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  36.17 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  39.74 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  37.14 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0298  50S ribosomal protein L5  34.56 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00106254  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  39.72 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  37.68 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  40.88 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1956  ribosomal protein L5  34.04 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0046  50S ribosomal protein L5  35.71 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.772489  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1765  50S ribosomal protein L5  34.04 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00103364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  38.73 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0277  50S ribosomal protein L5  43.07 
 
 		 187 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356643  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  36.55 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_429  ribosomal protein L5  39.52 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  38.58 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  36.55 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  40.16 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  36.55 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1021  50S ribosomal protein L5  34.04 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000164451  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  40.62 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  38.58 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  38.71 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  39.37 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  39.06 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  34.75 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  35.46 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>