More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2143 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 180 aa  357  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 180 aa  267  5e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  69.32 
 
 		 183 aa  263  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 179 aa  263  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 180 aa  261  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  68.54 
 
 		 179 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  68.54 
 
 		 179 aa  260  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  259  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 179 aa  259  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 179 aa  258  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 178 aa  258  4e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  257  7e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  254  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 		 192 aa  253  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 182 aa  252  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 181 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  67.61 
 
 		 190 aa  251  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 180 aa  251  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  250  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  250  9.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 180 aa  249  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 187 aa  248  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  65.73 
 
 		 192 aa  248  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  67.05 
 
 		 193 aa  248  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  64.61 
 
 		 189 aa  248  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 180 aa  248  5e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 179 aa  247  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 189 aa  247  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 180 aa  247  8e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 194 aa  246  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  63.28 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 182 aa  244  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 180 aa  244  4.9999999999999997e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 182 aa  244  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 182 aa  244  6.999999999999999e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 191 aa  243  8e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  64.77 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 193 aa  242  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  62.92 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 180 aa  241  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 187 aa  241  6e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 192 aa  240  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 190 aa  241  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  240  7.999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 181 aa  240  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  62.92 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  62.64 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 193 aa  239  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 220 aa  238  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0332  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000492925  hitchhiker  0.000510256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 243 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  61.49 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 189 aa  238  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 191 aa  238  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>