More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0097 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 169 aa  347  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  73.81 
 
 		 169 aa  266  7e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  59.15 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  59.76 
 
 		 165 aa  207  4e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  56.63 
 
 		 167 aa  204  5e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  56.29 
 
 		 174 aa  203  9e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  55.49 
 
 		 176 aa  197  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  56.02 
 
 		 168 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  56.1 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  55.49 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  57.41 
 
 		 169 aa  186  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  53.05 
 
 		 175 aa  185  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  51.5 
 
 		 171 aa  184  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  47.31 
 
 		 181 aa  167  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  45.24 
 
 		 181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  45.29 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  44.91 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  45.24 
 
 		 181 aa  159  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  44.05 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  43.45 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  45.45 
 
 		 182 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  40.72 
 
 		 174 aa  147  9e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  42.33 
 
 		 176 aa  140  6e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  42.59 
 
 		 175 aa  140  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  43.9 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  44.51 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  44.51 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  42.42 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  45.12 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  38.65 
 
 		 175 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.04 
 
 		 177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  40.12 
 
 		 174 aa  119  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  36.63 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 188 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  37.04 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1848  ribosomal protein L5  36.76 
 
 		 187 aa  91.7  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.21039e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 185 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0421  50S ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.889596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  37.04 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0600  50S ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0797735  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  39.1 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  38.81 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 179 aa  89  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  35.34 
 
 		 185 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 185 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0669  50S ribosomal protein L5  32.68 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.29336  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  37.04 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  33.12 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  33.12 
 
 		 179 aa  88.2  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  36.3 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  87.8  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 180 aa  87.8  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  36.3 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  37.78 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  36.76 
 
 		 181 aa  87.4  7e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  35.29 
 
 		 180 aa  87.8  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  87.8  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  36.84 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  35.56 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  36.96 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  39.71 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  35.06 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  36.09 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  37.04 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  35.56 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  33.83 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  36.03 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  35.34 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  38.03 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0238  50S ribosomal protein L5  38.52 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  37.04 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  33.33 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  85.5  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  35.51 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  35.07 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>