More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2305 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2305  50S ribosomal protein L5P  100 
 
 		 176 aa  356  8e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1841  50S ribosomal protein L5P  77.27 
 
 		 175 aa  279  2e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2231  ribosomal protein L5  68.97 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0223  ribosomal protein L5  71.01 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2436  50S ribosomal protein L5P  66.67 
 
 		 174 aa  244  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0097  50S ribosomal protein L5P  55.49 
 
 		 169 aa  197  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000268421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0014  50S ribosomal protein L5P  56.71 
 
 		 169 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  5.43993e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0455  50S ribosomal protein L5P  51.83 
 
 		 165 aa  187  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0122847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0577  50S ribosomal protein L5P  51.83 
 
 		 167 aa  178  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0545  50S ribosomal protein L5P  48.17 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.59077  normal  0.364222 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1715  50S ribosomal protein L5P  53.09 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0194222  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2240  50S ribosomal protein L5P  48.47 
 
 		 168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000000418435  normal  0.360377 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1397  50S ribosomal protein L5P  46.15 
 
 		 181 aa  170  7.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0723  50S ribosomal protein L5P  47.31 
 
 		 181 aa  164  4e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.305719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1261  50S ribosomal protein L5P  47.31 
 
 		 181 aa  161  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0207186  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0657  50S ribosomal protein L5P  46.71 
 
 		 181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.15981  decreased coverage  0.0000704942 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0166  50S ribosomal protein L5P  45.51 
 
 		 181 aa  160  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000530308  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0094  50S ribosomal protein L5P  45.24 
 
 		 171 aa  157  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.496979 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0104  50S ribosomal protein L5P  42.68 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  unclonable  0.0000000000310804  unclonable  0.000000485545 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0242  50S ribosomal protein L5P  42.77 
 
 		 182 aa  154  9e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1765  ribosomal protein L5  40.85 
 
 		 179 aa  151  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.553857  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1508  ribosomal protein L5  38.18 
 
 		 178 aa  141  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  2.2694e-16  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04475  60S ribosomal protein L11 (Broad)  39.77 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.147456 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03370  60s ribosomal protein l11, putative  38.73 
 
 		 175 aa  136  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0821316  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0907  50S ribosomal protein L5P  38.55 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.46697  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2221  50S ribosomal protein L5P  37.95 
 
 		 179 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.183607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2000  50S ribosomal protein L5P  37.95 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_23324  predicted protein  40.37 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0764  50S ribosomal protein L5P  37.95 
 
 		 179 aa  131  5e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.296859  normal  0.0880431 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1831  50S ribosomal protein L5P  38.69 
 
 		 197 aa  130  7.999999999999999e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0797  50S ribosomal protein L5P  36.97 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.268265 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30777  Ribosomal protein L11, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  38.65 
 
 		 177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131413 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72706  predicted protein  37.5 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  39.57 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  36.6 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  40.3 
 
 		 179 aa  98.2  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  40.46 
 
 		 181 aa  98.2  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  38.67 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  38.67 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  38.67 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  38.67 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  38.67 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  37.41 
 
 		 179 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  39.55 
 
 		 179 aa  95.9  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  36.03 
 
 		 186 aa  95.5  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  39.55 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  37.96 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  37.96 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 179 aa  94.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  37.96 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  38.81 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  34.64 
 
 		 179 aa  94.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  34.64 
 
 		 179 aa  94.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  37.4 
 
 		 183 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  36.69 
 
 		 179 aa  94.4  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 179 aa  94  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  38 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3810  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3989  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0243679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  38.17 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0600  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 177 aa  92.8  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0797735  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  38.93 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  33.55 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  37.12 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  34.53 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  35.53 
 
 		 179 aa  92.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  37.31 
 
 		 193 aa  92.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0421  50S ribosomal protein L5  35.88 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.889596  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  36.03 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  36.96 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03159  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000411475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0405  ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830558  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  35.29 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  35.29 
 
 		 185 aa  92  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4532  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349559  hitchhiker  0.000603292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3791  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000522149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3693  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000052658  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03110  hypothetical protein  38.69 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000280639  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4631  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000345599  normal  0.589642 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0405  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000176742  hitchhiker  0.0000151548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3603  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000337541  normal  0.028029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  35.82 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3502  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  92  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000625147  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  35.11 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  38.06 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  36.57 
 
 		 179 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  36.76 
 
 		 180 aa  91.7  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0595  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265071  normal  0.330939 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3902  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000139799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0295  50S ribosomal protein L5  38.69 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000120045  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  36.64 
 
 		 179 aa  91.3  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  34.33 
 
 		 188 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>