More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1934 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  82.39 
 
 		 189 aa  297  7e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  69.14 
 
 		 188 aa  260  6e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  69.14 
 
 		 188 aa  258  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  69.14 
 
 		 188 aa  258  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  68.57 
 
 		 188 aa  257  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  70.06 
 
 		 179 aa  257  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  68 
 
 		 188 aa  254  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  68 
 
 		 188 aa  254  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 		 180 aa  254  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 186 aa  253  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  68.36 
 
 		 179 aa  253  9e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 186 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 243 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 186 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  251  6e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  69.49 
 
 		 179 aa  251  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  69.49 
 
 		 179 aa  251  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 192 aa  250  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0331  50S ribosomal protein L5  67.8 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.86209e-22  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 184 aa  248  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  62.84 
 
 		 186 aa  248  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  64.52 
 
 		 186 aa  247  7e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0487  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 179 aa  247  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2313  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000920139  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0332  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000000492925  hitchhiker  0.000510256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  63.39 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  63.93 
 
 		 185 aa  244  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4231  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00181244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  62.3 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 193 aa  243  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 187 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1034  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000106866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0062  ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145784  hitchhiker  1.96626e-17 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  66.12 
 
 		 185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  64 
 
 		 197 aa  241  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  240  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 180 aa  240  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  60.66 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3937  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0065  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000146206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  61.2 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  61.2 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0506  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0585941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 181 aa  236  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0445  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0266949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  61.75 
 
 		 185 aa  234  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  61.96 
 
 		 185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  66.12 
 
 		 185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  63.93 
 
 		 185 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>