More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1366 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  85.94 
 
 		 243 aa  349  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  78.8 
 
 		 185 aa  317  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  75.14 
 
 		 188 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  75.14 
 
 		 188 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 188 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  76.11 
 
 		 188 aa  299  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  76.11 
 
 		 188 aa  297  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  76.11 
 
 		 188 aa  297  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  74.72 
 
 		 185 aa  289  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  74.72 
 
 		 185 aa  289  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  72.83 
 
 		 185 aa  289  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 		 185 aa  287  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  73.63 
 
 		 185 aa  281  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  70.56 
 
 		 185 aa  278  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  70 
 
 		 185 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  68.33 
 
 		 185 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  67.78 
 
 		 185 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  68.33 
 
 		 185 aa  277  9e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  68.33 
 
 		 185 aa  274  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  67.78 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  69.57 
 
 		 185 aa  272  3e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  71.35 
 
 		 193 aa  270  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 		 186 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 		 193 aa  265  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  68.16 
 
 		 186 aa  265  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 186 aa  264  7e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  71.2 
 
 		 185 aa  264  7e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  72.28 
 
 		 185 aa  264  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  71.2 
 
 		 185 aa  262  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 192 aa  263  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 186 aa  261  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  71.74 
 
 		 185 aa  260  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  67.42 
 
 		 185 aa  259  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 179 aa  254  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  67.42 
 
 		 186 aa  254  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 187 aa  249  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  245  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 180 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 187 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 183 aa  242  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 183 aa  241  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 183 aa  241  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  241  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  241  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  241  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000500711  hitchhiker  0.00000237864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  60.54 
 
 		 187 aa  240  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000312511  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3937  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 183 aa  240  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  59.32 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000331998  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>