More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1341 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  78.65 
 
 		 192 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  79.78 
 
 		 193 aa  307  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  72.68 
 
 		 185 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  71.58 
 
 		 185 aa  274  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  71.58 
 
 		 185 aa  274  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  70 
 
 		 188 aa  272  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  68.85 
 
 		 185 aa  267  8e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  69.66 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  69.1 
 
 		 197 aa  264  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  71.04 
 
 		 185 aa  263  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  67.22 
 
 		 188 aa  259  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  67.76 
 
 		 185 aa  259  2e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 188 aa  258  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  66.11 
 
 		 188 aa  258  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  67.98 
 
 		 180 aa  257  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  66.11 
 
 		 188 aa  257  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  66.11 
 
 		 188 aa  257  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  68.18 
 
 		 185 aa  256  1e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  65.75 
 
 		 183 aa  256  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  68 
 
 		 179 aa  253  9e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 186 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 186 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 185 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 186 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 185 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 187 aa  248  3e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 186 aa  248  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  65.88 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 185 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  67.42 
 
 		 186 aa  247  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 185 aa  246  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  63.22 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 185 aa  244  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 180 aa  243  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  67.21 
 
 		 185 aa  242  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  65.29 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 185 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000331998  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3490  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2620  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0483122  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0065  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  241  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 180 aa  241  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0279  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000228598  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  62.57 
 
 		 189 aa  241  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0288  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152111  normal  0.01295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  67.76 
 
 		 185 aa  240  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 178 aa  240  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 185 aa  240  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 187 aa  239  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 178 aa  239  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  64.71 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  64.71 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0062  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145784  hitchhiker  1.96626e-17 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  62.09 
 
 		 184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  64.71 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  64.12 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  60.99 
 
 		 187 aa  238  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>