More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1442 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  98.38 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  94.59 
 
 		 185 aa  344  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  92.43 
 
 		 185 aa  340  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  82.7 
 
 		 185 aa  320  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  79.46 
 
 		 185 aa  308  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  79.46 
 
 		 185 aa  308  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  79.46 
 
 		 185 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  77.3 
 
 		 185 aa  304  5.0000000000000004e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  76.76 
 
 		 185 aa  300  6.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  74.32 
 
 		 185 aa  293  9e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  75 
 
 		 188 aa  292  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  75 
 
 		 188 aa  292  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  73.94 
 
 		 188 aa  290  8e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  73.77 
 
 		 185 aa  286  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  73.63 
 
 		 243 aa  286  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  72.34 
 
 		 188 aa  284  5.999999999999999e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  70.74 
 
 		 188 aa  280  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  70.21 
 
 		 188 aa  279  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  73.33 
 
 		 197 aa  278  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  68.11 
 
 		 185 aa  278  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  68.11 
 
 		 185 aa  277  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  69.19 
 
 		 185 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  71.67 
 
 		 186 aa  270  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  66.49 
 
 		 185 aa  270  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 186 aa  268  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  67.4 
 
 		 187 aa  268  5e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  67.21 
 
 		 186 aa  267  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  65.41 
 
 		 185 aa  266  8.999999999999999e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  65.57 
 
 		 186 aa  264  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  65.57 
 
 		 186 aa  264  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  64.67 
 
 		 187 aa  255  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 		 193 aa  253  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  67.21 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 192 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 185 aa  249  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  62.43 
 
 		 186 aa  245  3e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  59.46 
 
 		 186 aa  243  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 183 aa  241  5e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 193 aa  238  5e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 178 aa  235  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 178 aa  235  3e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  234  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  62.64 
 
 		 189 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  61.67 
 
 		 191 aa  233  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  61.8 
 
 		 189 aa  231  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 180 aa  230  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.19 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  58.7 
 
 		 198 aa  229  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>