More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0298 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  100 
 
 
180 aa  364  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 
179 aa  296  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  76.84 
 
 
181 aa  293  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  74.44 
 
 
180 aa  288  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  75.71 
 
 
183 aa  286  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  71.35 
 
 
179 aa  276  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  71.35 
 
 
179 aa  276  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  72.88 
 
 
182 aa  276  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  71.19 
 
 
179 aa  276  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  71.11 
 
 
180 aa  275  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  68.89 
 
 
180 aa  273  1.0000000000000001e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  70.62 
 
 
179 aa  271  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  270  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  70.22 
 
 
179 aa  269  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  70.22 
 
 
179 aa  269  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  70.22 
 
 
179 aa  269  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  70.06 
 
 
179 aa  269  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  70.06 
 
 
179 aa  269  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  70.22 
 
 
179 aa  269  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  68.36 
 
 
180 aa  268  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  70.22 
 
 
179 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  69.66 
 
 
179 aa  268  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  69.66 
 
 
179 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  69.66 
 
 
179 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 
180 aa  267  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  68.54 
 
 
179 aa  266  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  69.14 
 
 
192 aa  266  8.999999999999999e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 
179 aa  266  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  68 
 
 
193 aa  265  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 
179 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 
179 aa  265  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 
179 aa  265  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  67.42 
 
 
178 aa  265  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  68 
 
 
180 aa  262  2e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  261  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  70.86 
 
 
179 aa  259  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  257  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
193 aa  257  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  257  7e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
180 aa  256  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 
179 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  63.84 
 
 
179 aa  254  3e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  254  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  254  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  254  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 
180 aa  253  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 
180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
182 aa  252  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
181 aa  251  3e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 
182 aa  250  6e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  67.05 
 
 
180 aa  250  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
180 aa  250  8.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 
180 aa  249  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
179 aa  249  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
179 aa  248  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
182 aa  249  2e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
182 aa  249  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 
179 aa  248  2e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
179 aa  249  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  248  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  65.52 
 
 
180 aa  248  2e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  249  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  64.61 
 
 
189 aa  248  2e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  63.48 
 
 
192 aa  248  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  64.77 
 
 
181 aa  248  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.55 
 
 
179 aa  248  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  64.04 
 
 
191 aa  247  5e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 
179 aa  247  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 
189 aa  247  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
179 aa  247  7e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  247  8e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
179 aa  246  9e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 
179 aa  246  9e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  63.64 
 
 
190 aa  246  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 
179 aa  246  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 
179 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 
179 aa  246  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  63.22 
 
 
180 aa  246  1e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
179 aa  246  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  63.48 
 
 
190 aa  246  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 
193 aa  246  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 
180 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 
180 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 
180 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
179 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0509  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
180 aa  245  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0543565  hitchhiker  0.000000000388642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0339  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
180 aa  245  3e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
189 aa  245  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  64.77 
 
 
191 aa  245  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
194 aa  244  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 
179 aa  245  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  65.14 
 
 
191 aa  244  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 
187 aa  244  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 
179 aa  244  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.99 
 
 
179 aa  244  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>