More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1344 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  98.38 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  92.97 
 
 		 185 aa  338  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  92.43 
 
 		 185 aa  338  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  82.16 
 
 		 185 aa  317  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  78.92 
 
 		 185 aa  304  6e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  78.92 
 
 		 185 aa  304  6e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  78.92 
 
 		 185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  76.76 
 
 		 185 aa  300  8.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  76.22 
 
 		 185 aa  297  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 		 185 aa  291  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  73.4 
 
 		 188 aa  286  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  73.4 
 
 		 188 aa  286  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  72.34 
 
 		 188 aa  284  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  73.22 
 
 		 185 aa  283  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  73.08 
 
 		 243 aa  282  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  70.74 
 
 		 188 aa  278  3e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  70.21 
 
 		 188 aa  276  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  69.68 
 
 		 188 aa  275  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  72.78 
 
 		 197 aa  275  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 185 aa  273  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  68.11 
 
 		 185 aa  270  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  72.22 
 
 		 186 aa  269  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  65.95 
 
 		 185 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  67.96 
 
 		 187 aa  266  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  65.41 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  65.95 
 
 		 185 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  66.12 
 
 		 186 aa  263  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 186 aa  262  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  66.12 
 
 		 186 aa  262  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  66.12 
 
 		 186 aa  262  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  64.32 
 
 		 185 aa  262  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 193 aa  252  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  64.13 
 
 		 187 aa  251  5.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  67.76 
 
 		 193 aa  251  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 192 aa  249  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  66.12 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  62.98 
 
 		 186 aa  243  9e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  58.92 
 
 		 186 aa  239  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 183 aa  237  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  235  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 193 aa  234  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  233  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  61.67 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 178 aa  232  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 178 aa  231  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  61.8 
 
 		 189 aa  231  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  58.7 
 
 		 198 aa  229  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  59.56 
 
 		 191 aa  228  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  62.09 
 
 		 189 aa  228  3e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 180 aa  227  6e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 180 aa  227  8e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 189 aa  226  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  57.63 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  58.56 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>