More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1666 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  84.32 
 
 		 185 aa  332  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  84.32 
 
 		 185 aa  332  2e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  84.86 
 
 		 185 aa  330  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  80 
 
 		 185 aa  315  2e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  83.78 
 
 		 185 aa  312  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  82.7 
 
 		 185 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  81.08 
 
 		 185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  82.16 
 
 		 185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  74.05 
 
 		 185 aa  299  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  75.27 
 
 		 243 aa  298  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  72.68 
 
 		 188 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  72.68 
 
 		 188 aa  291  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  75.96 
 
 		 185 aa  291  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  72.13 
 
 		 188 aa  289  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  72.13 
 
 		 188 aa  288  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  72.68 
 
 		 188 aa  288  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  72.68 
 
 		 188 aa  288  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  73.89 
 
 		 197 aa  288  4e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  69.19 
 
 		 185 aa  280  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  69.4 
 
 		 185 aa  279  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  68.11 
 
 		 185 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  68.65 
 
 		 185 aa  277  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  69.19 
 
 		 185 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  69.19 
 
 		 185 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  67.76 
 
 		 186 aa  274  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 185 aa  273  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  67.57 
 
 		 185 aa  273  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  67.4 
 
 		 186 aa  267  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  66.3 
 
 		 186 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  66.3 
 
 		 186 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  65.19 
 
 		 187 aa  260  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  67.76 
 
 		 193 aa  259  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  65.75 
 
 		 187 aa  258  3e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 192 aa  256  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  67.78 
 
 		 186 aa  254  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 193 aa  252  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  63.93 
 
 		 185 aa  244  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  243  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  61.88 
 
 		 186 aa  242  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 187 aa  240  7e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  240  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 189 aa  239  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 183 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 183 aa  238  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 183 aa  238  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2312  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 181 aa  237  6.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000116558  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  58.92 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  59.32 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 193 aa  235  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 193 aa  235  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  62.92 
 
 		 189 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3810  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000450853  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>