More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0279 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 187 aa  376  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0277  50S ribosomal protein L5  72.04 
 
 		 187 aa  263  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  67.58 
 
 		 183 aa  260  6.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  70.11 
 
 		 179 aa  258  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  69.32 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  68.18 
 
 		 179 aa  254  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 193 aa  248  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  247  8e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 180 aa  244  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 180 aa  244  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  63.64 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  243  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  60.87 
 
 		 185 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 193 aa  241  3.9999999999999997e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 192 aa  241  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 185 aa  240  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  240  7.999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  240  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 189 aa  240  9e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 181 aa  240  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 193 aa  239  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 243 aa  239  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 223 aa  238  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 197 aa  238  5e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  237  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  59.67 
 
 		 188 aa  237  8e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0340  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 181 aa  237  8e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  237  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 194 aa  236  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  59.12 
 
 		 188 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  60.8 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 183 aa  235  3e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 183 aa  235  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 181 aa  234  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  58.56 
 
 		 188 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  58.56 
 
 		 188 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 180 aa  234  7e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  60.92 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  58.56 
 
 		 188 aa  234  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 190 aa  234  8e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  58.56 
 
 		 188 aa  233  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  62.07 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  60 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  62.09 
 
 		 185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  59.55 
 
 		 191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>