More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2915 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  78.89 
 
 		 180 aa  306  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 		 179 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  73.18 
 
 		 179 aa  283  8e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  73.74 
 
 		 179 aa  280  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  72.07 
 
 		 180 aa  280  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 179 aa  277  6e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 179 aa  277  6e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  72.07 
 
 		 179 aa  277  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  71.67 
 
 		 180 aa  277  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  72.88 
 
 		 180 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  70.95 
 
 		 179 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  70.62 
 
 		 181 aa  272  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  71.19 
 
 		 180 aa  270  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 179 aa  270  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  70 
 
 		 183 aa  267  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  69.49 
 
 		 180 aa  267  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  70.39 
 
 		 179 aa  265  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  70.39 
 
 		 179 aa  265  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  70.39 
 
 		 179 aa  265  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  70.39 
 
 		 179 aa  265  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 179 aa  265  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  68.93 
 
 		 180 aa  264  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  67.23 
 
 		 178 aa  265  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 179 aa  264  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 179 aa  264  5e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 179 aa  264  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 179 aa  264  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  69.83 
 
 		 179 aa  264  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  69.27 
 
 		 179 aa  263  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 179 aa  261  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  69.27 
 
 		 179 aa  261  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 180 aa  259  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  68.93 
 
 		 180 aa  259  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 180 aa  258  3e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  68.18 
 
 		 180 aa  257  5.0000000000000005e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  64.44 
 
 		 180 aa  256  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  67.04 
 
 		 179 aa  253  9e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  68.16 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  67.04 
 
 		 179 aa  250  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  61.88 
 
 		 181 aa  250  8.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  67.04 
 
 		 179 aa  250  8.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  66.86 
 
 		 180 aa  250  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 192 aa  249  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  63.48 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  64.09 
 
 		 184 aa  248  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  247  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  247  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 193 aa  245  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  243  8e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  243  9e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 180 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  63.79 
 
 		 181 aa  243  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  61.45 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 220 aa  242  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 180 aa  240  6e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 180 aa  240  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 182 aa  240  1e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  237  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  59.78 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 186 aa  237  8e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>