More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1855 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  71.19 
 
 		 182 aa  277  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  69.32 
 
 		 182 aa  274  4e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 		 179 aa  260  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  254  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  68.16 
 
 		 179 aa  254  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  65.91 
 
 		 180 aa  251  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 		 181 aa  249  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 180 aa  248  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  64.8 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  66.86 
 
 		 183 aa  248  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  247  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  247  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 181 aa  247  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  247  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 179 aa  246  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  63.79 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 180 aa  245  3e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  244  3e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 182 aa  243  9e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 182 aa  243  9.999999999999999e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 		 182 aa  241  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 182 aa  238  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  59.32 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  62.07 
 
 		 193 aa  237  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  236  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  236  9e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  59.78 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  234  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 180 aa  234  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  62.07 
 
 		 191 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  59.78 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 185 aa  234  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 180 aa  233  8e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 180 aa  232  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 243 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 188 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>