More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3012 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
180 aa  362  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  73.33 
 
 
180 aa  290  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  74.16 
 
 
180 aa  281  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  73.45 
 
 
179 aa  280  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1173  50S ribosomal protein L5  74.44 
 
 
180 aa  275  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00494805  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  69.32 
 
 
183 aa  267  5.9999999999999995e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  67.05 
 
 
179 aa  263  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  68 
 
 
179 aa  263  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  69.32 
 
 
179 aa  262  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  67.61 
 
 
178 aa  261  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 
182 aa  261  4e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
179 aa  259  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  63.89 
 
 
180 aa  257  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 
179 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
182 aa  257  6e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
181 aa  256  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 
180 aa  255  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 
180 aa  255  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
180 aa  255  3e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 
220 aa  254  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 
181 aa  254  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  64.57 
 
 
180 aa  254  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  254  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  251  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
179 aa  251  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  63.28 
 
 
180 aa  250  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  66.86 
 
 
182 aa  250  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
179 aa  249  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  249  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  248  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  248  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  248  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  64.57 
 
 
191 aa  248  4e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  248  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  248  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  66.86 
 
 
179 aa  247  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 
180 aa  247  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
179 aa  247  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 
180 aa  245  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
180 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
180 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
180 aa  245  2e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 
180 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 
180 aa  246  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
198 aa  244  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
180 aa  244  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
189 aa  243  9e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  243  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  243  9e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  66.48 
 
 
184 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
180 aa  241  3e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 
180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
184 aa  241  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  63.79 
 
 
179 aa  241  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 
179 aa  240  7e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 
179 aa  240  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
191 aa  239  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  239  1e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  239  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  59.78 
 
 
191 aa  239  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000500711  hitchhiker  0.00000237864 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000312511  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0509  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 
180 aa  238  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0543565  hitchhiker  0.000000000388642 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0339  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 
180 aa  238  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
180 aa  237  5e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 
179 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
180 aa  236  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  62.15 
 
 
191 aa  236  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
180 aa  234  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  56.74 
 
 
193 aa  234  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
196 aa  234  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  59.22 
 
 
191 aa  232  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  59.89 
 
 
189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17281  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
178 aa  231  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.805696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  58.43 
 
 
181 aa  231  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0065  50S ribosomal protein L5  56.67 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000146206  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  57.87 
 
 
186 aa  231  4.0000000000000004e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  231  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  231  5e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>