More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1471 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 180 aa  367  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  84.44 
 
 		 180 aa  318  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  81.67 
 
 		 180 aa  309  1e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  80.56 
 
 		 180 aa  308  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  82.22 
 
 		 180 aa  305  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  79.44 
 
 		 180 aa  301  4.0000000000000003e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 		 179 aa  295  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 		 179 aa  295  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  77.22 
 
 		 180 aa  293  7e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 		 179 aa  293  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 		 179 aa  293  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 		 179 aa  292  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 		 179 aa  291  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 		 179 aa  291  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 		 179 aa  291  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 		 179 aa  290  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  76.97 
 
 		 179 aa  290  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 		 179 aa  290  6e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  75.28 
 
 		 179 aa  288  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 		 179 aa  284  5e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  69.49 
 
 		 179 aa  269  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  69.14 
 
 		 179 aa  265  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  69.14 
 
 		 183 aa  263  8e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  67.43 
 
 		 178 aa  263  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 180 aa  260  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  68.57 
 
 		 180 aa  260  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  260  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 182 aa  259  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  65 
 
 		 180 aa  255  2e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 181 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  65 
 
 		 180 aa  253  8e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  253  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  67.43 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 193 aa  249  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  65.14 
 
 		 180 aa  249  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 180 aa  248  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  61.49 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  244  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 180 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 180 aa  243  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  60.8 
 
 		 179 aa  243  9e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 220 aa  242  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  61.58 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  240  7.999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 192 aa  240  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  62.07 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  60.45 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 185 aa  238  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf430  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 187 aa  238  5e-62  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 		 184 aa  238  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 179 aa  237  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 187 aa  235  3e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 191 aa  235  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 182 aa  235  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 186 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 186 aa  234  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 181 aa  233  9e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 186 aa  233  9e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 183 aa  231  3e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 186 aa  231  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 184 aa  231  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>