More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0945 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 179 aa  360  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  99.44 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  87.71 
 
 		 179 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  80.45 
 
 		 179 aa  301  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  80.45 
 
 		 179 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  79.89 
 
 		 179 aa  298  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 		 179 aa  288  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  69.89 
 
 		 184 aa  267  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  69.66 
 
 		 179 aa  266  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  65.92 
 
 		 179 aa  265  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 179 aa  264  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  68.54 
 
 		 179 aa  263  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  65.92 
 
 		 179 aa  263  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  67.05 
 
 		 183 aa  262  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  68.36 
 
 		 180 aa  259  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  68.36 
 
 		 180 aa  259  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  68.36 
 
 		 180 aa  259  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  68.93 
 
 		 180 aa  259  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 178 aa  259  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  258  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  258  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  258  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  258  4e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  257  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  257  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 		 179 aa  256  9e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 		 181 aa  255  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 180 aa  254  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  254  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  254  6e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 180 aa  254  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 179 aa  253  9e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 180 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 182 aa  251  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 180 aa  251  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  61.24 
 
 		 179 aa  250  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 179 aa  250  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  250  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  250  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  250  7e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 182 aa  250  8.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 179 aa  250  9.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0288  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152111  normal  0.01295 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3490  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0279  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000228598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000331998  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2620  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0483122  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000500711  hitchhiker  0.00000237864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  248  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000312511  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  67.23 
 
 		 184 aa  248  5e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 180 aa  247  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  247  5e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  247  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  247  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 180 aa  247  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  63.28 
 
 		 179 aa  246  9e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  246  9e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0406  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0381  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 223 aa  246  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 		 180 aa  246  1e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>