More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1149 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  100 
 
 		 186 aa  383  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  67.04 
 
 		 181 aa  264  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  67.21 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 192 aa  259  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  65.03 
 
 		 187 aa  259  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  65.03 
 
 		 191 aa  256  1e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  64.84 
 
 		 193 aa  255  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  65.38 
 
 		 193 aa  254  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  63.84 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  65.56 
 
 		 191 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  64.13 
 
 		 188 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  65.22 
 
 		 191 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  63.74 
 
 		 189 aa  252  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 		 180 aa  250  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  64.41 
 
 		 179 aa  250  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  64.41 
 
 		 180 aa  249  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  65.38 
 
 		 189 aa  248  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 183 aa  247  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  247  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  247  7e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 179 aa  247  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  247  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  63.24 
 
 		 194 aa  247  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 190 aa  246  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  64.67 
 
 		 189 aa  246  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  63.83 
 
 		 189 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 198 aa  245  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  245  3e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  62.7 
 
 		 189 aa  245  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 181 aa  244  4e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 199 aa  244  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 192 aa  244  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 190 aa  244  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 180 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  59.02 
 
 		 185 aa  243  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 186 aa  243  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  243  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 178 aa  243  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0340  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 181 aa  243  9.999999999999999e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 243 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 180 aa  243  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  62.43 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  59.56 
 
 		 185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 186 aa  242  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  60.54 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  60.54 
 
 		 185 aa  241  5e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  66.47 
 
 		 184 aa  241  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 180 aa  240  9e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  61.54 
 
 		 187 aa  240  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  58.38 
 
 		 185 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>