More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  100 
 
 		 189 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  87.23 
 
 		 187 aa  341  4e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  86.02 
 
 		 191 aa  326  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  84.95 
 
 		 190 aa  325  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  82.42 
 
 		 199 aa  312  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  79.03 
 
 		 190 aa  310  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  77.96 
 
 		 198 aa  305  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  77.13 
 
 		 191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  80.85 
 
 		 189 aa  303  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  80 
 
 		 193 aa  303  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  75.92 
 
 		 192 aa  301  5.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  75 
 
 		 189 aa  300  7.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  79.01 
 
 		 193 aa  300  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  75 
 
 		 189 aa  297  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  76.19 
 
 		 194 aa  296  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  75 
 
 		 191 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  76.06 
 
 		 189 aa  292  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  75 
 
 		 191 aa  290  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  74.33 
 
 		 192 aa  289  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  72.83 
 
 		 187 aa  284  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  73.12 
 
 		 188 aa  283  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  72.47 
 
 		 196 aa  281  4.0000000000000003e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  76.74 
 
 		 184 aa  277  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  75.27 
 
 		 192 aa  274  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  75.53 
 
 		 189 aa  271  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  71.11 
 
 		 190 aa  271  3e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  76.09 
 
 		 187 aa  270  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  76.63 
 
 		 187 aa  270  7e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  74.47 
 
 		 189 aa  270  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  74.47 
 
 		 189 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  67.2 
 
 		 190 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  73.37 
 
 		 192 aa  264  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  72.34 
 
 		 189 aa  263  8.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  73.37 
 
 		 187 aa  261  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  73.37 
 
 		 187 aa  261  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  73.37 
 
 		 187 aa  261  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  73.12 
 
 		 188 aa  258  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  66.3 
 
 		 189 aa  255  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  76.92 
 
 		 199 aa  254  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  63.83 
 
 		 186 aa  246  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  64.04 
 
 		 180 aa  241  6e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 178 aa  233  9e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 183 aa  231  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 180 aa  231  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  59.44 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 178 aa  227  6e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  60.45 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 180 aa  225  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 180 aa  225  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  56.11 
 
 		 182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  224  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 180 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 185 aa  224  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 180 aa  224  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  57.22 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>