More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0410 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  100 
 
 		 189 aa  378  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  67.42 
 
 		 190 aa  259  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  66.3 
 
 		 189 aa  255  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  67.61 
 
 		 180 aa  255  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  64.32 
 
 		 187 aa  254  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  67.23 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  65 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  65.24 
 
 		 189 aa  251  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  65 
 
 		 193 aa  250  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  65.56 
 
 		 199 aa  250  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  63.98 
 
 		 188 aa  247  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  66.48 
 
 		 192 aa  247  7e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 198 aa  247  7e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  64.67 
 
 		 186 aa  246  1e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 191 aa  245  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 194 aa  244  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  69.41 
 
 		 184 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  62.37 
 
 		 190 aa  242  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 183 aa  242  3e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  62.37 
 
 		 191 aa  241  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  61.5 
 
 		 189 aa  239  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  60.11 
 
 		 181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  62.3 
 
 		 192 aa  238  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 191 aa  238  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  62.16 
 
 		 191 aa  237  9e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 187 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 183 aa  236  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17281  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 		 178 aa  235  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.805696  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  64.48 
 
 		 192 aa  233  9e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 178 aa  230  9e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  68.93 
 
 		 187 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  68.93 
 
 		 187 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  68.93 
 
 		 187 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 178 aa  228  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  65.41 
 
 		 189 aa  226  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  56.83 
 
 		 223 aa  226  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  63.44 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 190 aa  224  6e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  60 
 
 		 191 aa  224  8e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 182 aa  223  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  57.63 
 
 		 190 aa  222  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  62.3 
 
 		 189 aa  222  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 192 aa  221  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 182 aa  221  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.19 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  220  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>