More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2166 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  100 
 
 		 183 aa  374  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  82.22 
 
 		 181 aa  313  7e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  83.15 
 
 		 180 aa  308  2.9999999999999997e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 194 aa  247  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 186 aa  246  9e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 191 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  64.44 
 
 		 189 aa  245  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 193 aa  242  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 		 198 aa  241  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 193 aa  240  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  65.17 
 
 		 192 aa  239  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  65.36 
 
 		 191 aa  239  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 190 aa  237  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  236  9e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 190 aa  236  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  60.8 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  63.33 
 
 		 192 aa  235  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 191 aa  235  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  65.17 
 
 		 189 aa  234  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  63.48 
 
 		 191 aa  234  5.0000000000000005e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 189 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  62.22 
 
 		 187 aa  234  5.0000000000000005e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 187 aa  234  7e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  62.92 
 
 		 190 aa  232  2.0000000000000002e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  62.92 
 
 		 189 aa  231  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 188 aa  232  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 183 aa  231  5e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 181 aa  230  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 182 aa  230  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 181 aa  229  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  59.09 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  228  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  60.77 
 
 		 191 aa  228  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 178 aa  228  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 189 aa  227  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  55.49 
 
 		 182 aa  226  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>