More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3131 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  100 
 
 		 199 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  86.56 
 
 		 191 aa  327  5.0000000000000004e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  81.05 
 
 		 192 aa  321  6e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  84.36 
 
 		 187 aa  315  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  82.42 
 
 		 189 aa  312  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  83.71 
 
 		 190 aa  311  2.9999999999999996e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  77.9 
 
 		 189 aa  310  6.999999999999999e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  79.68 
 
 		 190 aa  310  9e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  79.57 
 
 		 189 aa  309  1e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  79.78 
 
 		 191 aa  309  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  76.92 
 
 		 198 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  78.26 
 
 		 193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  76.44 
 
 		 191 aa  303  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  75.63 
 
 		 194 aa  303  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  78.65 
 
 		 193 aa  301  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  75.94 
 
 		 188 aa  301  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  76.67 
 
 		 191 aa  299  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  76.88 
 
 		 189 aa  296  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 		 187 aa  296  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  77.09 
 
 		 189 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  69.54 
 
 		 196 aa  292  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  77.4 
 
 		 192 aa  291  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  75 
 
 		 192 aa  283  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  79.33 
 
 		 187 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  79.33 
 
 		 187 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  79.33 
 
 		 187 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  76.88 
 
 		 189 aa  278  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  80.56 
 
 		 189 aa  276  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  77.06 
 
 		 184 aa  275  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  68.45 
 
 		 190 aa  275  4e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  77.65 
 
 		 187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  70.05 
 
 		 190 aa  273  1.0000000000000001e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  78.77 
 
 		 188 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  77.09 
 
 		 192 aa  271  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  75.27 
 
 		 187 aa  270  8.000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  78.21 
 
 		 189 aa  269  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  78.21 
 
 		 189 aa  269  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  73.87 
 
 		 199 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  65.56 
 
 		 189 aa  250  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 186 aa  244  4e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 180 aa  241  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 180 aa  241  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60 
 
 		 183 aa  238  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 178 aa  237  9e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  63.69 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 178 aa  237  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  62.36 
 
 		 180 aa  234  6e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  234  9e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  60.67 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 193 aa  227  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 193 aa  225  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  59.34 
 
 		 185 aa  225  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  59.44 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 180 aa  225  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 223 aa  224  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 220 aa  224  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 191 aa  224  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.3 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  58.47 
 
 		 243 aa  224  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  59.24 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  59.24 
 
 		 185 aa  223  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 192 aa  222  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 180 aa  222  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.72 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 182 aa  221  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  55.43 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 180 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  57.69 
 
 		 183 aa  221  6e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 180 aa  221  6e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 184 aa  221  7e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 193 aa  221  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  57.69 
 
 		 183 aa  220  8e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 178 aa  221  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  57.56 
 
 		 179 aa  220  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  220  9e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 181 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>