More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0965 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  82.78 
 
 
184 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  82.78 
 
 
193 aa  311  3.9999999999999997e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1126  50S ribosomal protein L5  79.01 
 
 
184 aa  310  7.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0974998  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0778  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 
185 aa  264  5e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.807556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
179 aa  246  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  65.91 
 
 
179 aa  246  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 
193 aa  243  8e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
179 aa  241  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 
179 aa  240  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.88 
 
 
183 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  63.07 
 
 
179 aa  235  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
179 aa  235  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
182 aa  234  8e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
180 aa  233  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  60.45 
 
 
180 aa  233  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  63.79 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  59.55 
 
 
182 aa  231  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  231  6e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  230  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  60.92 
 
 
179 aa  229  1e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  229  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  59.02 
 
 
191 aa  229  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 
192 aa  228  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  228  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
179 aa  228  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 
188 aa  228  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
180 aa  228  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  57.78 
 
 
188 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  57.78 
 
 
188 aa  226  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  57.78 
 
 
188 aa  226  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  226  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  60.57 
 
 
180 aa  226  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  60 
 
 
181 aa  226  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  58.89 
 
 
188 aa  225  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  58.29 
 
 
199 aa  225  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  56.35 
 
 
243 aa  225  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
193 aa  224  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  224  6e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  57.78 
 
 
188 aa  224  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  224  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  222  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 
187 aa  222  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  57.14 
 
 
192 aa  222  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 
180 aa  222  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  56.11 
 
 
185 aa  222  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 
178 aa  221  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 
193 aa  221  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
180 aa  221  4e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 
181 aa  221  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
189 aa  221  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 
179 aa  220  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 
187 aa  220  7e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
186 aa  220  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  57.71 
 
 
189 aa  220  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  57.71 
 
 
189 aa  220  9e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
186 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 
180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
185 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 
185 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  54.95 
 
 
186 aa  218  3e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  53.89 
 
 
185 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
182 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 
198 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  54.86 
 
 
179 aa  218  5e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  56 
 
 
192 aa  218  5e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
185 aa  218  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 
179 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 
194 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  53.07 
 
 
179 aa  217  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  217  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  217  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  217  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  217  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 
185 aa  217  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
180 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
180 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  56.57 
 
 
190 aa  217  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 
179 aa  217  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 
180 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 
193 aa  217  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  54.14 
 
 
197 aa  216  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 
191 aa  216  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 
179 aa  216  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>