More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  100 
 
 		 189 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  80.56 
 
 		 199 aa  307  6.999999999999999e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  79.44 
 
 		 191 aa  306  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  79.79 
 
 		 188 aa  306  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  75.13 
 
 		 189 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  77.96 
 
 		 191 aa  300  7.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  78.19 
 
 		 187 aa  298  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  75.66 
 
 		 192 aa  297  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  83.51 
 
 		 187 aa  296  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  77.01 
 
 		 192 aa  296  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  78.19 
 
 		 189 aa  291  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  74.74 
 
 		 190 aa  291  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  78.19 
 
 		 189 aa  291  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  74.59 
 
 		 191 aa  291  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  73.54 
 
 		 189 aa  290  7e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  72.34 
 
 		 189 aa  290  7e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  73.4 
 
 		 191 aa  290  1e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  81.38 
 
 		 192 aa  287  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  72.87 
 
 		 189 aa  287  7e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 		 194 aa  287  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  75 
 
 		 187 aa  287  8e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  76.27 
 
 		 193 aa  285  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 		 198 aa  285  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  76.88 
 
 		 192 aa  284  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  80.85 
 
 		 187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  75 
 
 		 189 aa  283  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  80.85 
 
 		 187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  80.85 
 
 		 187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  73.48 
 
 		 193 aa  282  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  78.72 
 
 		 187 aa  277  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  73.18 
 
 		 196 aa  277  8e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  78.49 
 
 		 188 aa  275  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  74.16 
 
 		 190 aa  275  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 190 aa  273  7e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  72.07 
 
 		 190 aa  272  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  76.72 
 
 		 189 aa  272  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  73.53 
 
 		 184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  78.33 
 
 		 199 aa  250  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  61.62 
 
 		 186 aa  242  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  62.43 
 
 		 189 aa  235  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 180 aa  232  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 183 aa  231  4.0000000000000004e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 178 aa  229  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 178 aa  229  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 182 aa  228  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 182 aa  227  8e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  59.22 
 
 		 181 aa  227  9e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  60.34 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 180 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  60 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 183 aa  223  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  57.63 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 187 aa  222  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  221  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  55.93 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  221  4e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 192 aa  221  7e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  220  9e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>