More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3419 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  86.17 
 
 		 188 aa  330  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  79.68 
 
 		 187 aa  314  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  87.17 
 
 		 192 aa  313  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  85.56 
 
 		 187 aa  308  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  86.1 
 
 		 187 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  86.1 
 
 		 187 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  86.1 
 
 		 187 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  78.8 
 
 		 192 aa  303  9.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  77.01 
 
 		 187 aa  303  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  86.17 
 
 		 188 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  78.92 
 
 		 198 aa  302  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  79.23 
 
 		 192 aa  299  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  75.27 
 
 		 199 aa  296  1e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  76.63 
 
 		 189 aa  295  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  75 
 
 		 191 aa  293  8e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  80 
 
 		 192 aa  292  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  76.09 
 
 		 193 aa  291  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  75.54 
 
 		 190 aa  290  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 189 aa  288  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  75 
 
 		 193 aa  287  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  78.49 
 
 		 189 aa  287  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  74.3 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  76.4 
 
 		 191 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  72.04 
 
 		 189 aa  285  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  73.12 
 
 		 190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  76.88 
 
 		 189 aa  282  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  76.88 
 
 		 189 aa  282  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  72.68 
 
 		 194 aa  281  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  77.91 
 
 		 184 aa  281  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  74.16 
 
 		 191 aa  279  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  71.51 
 
 		 189 aa  278  3e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  77.01 
 
 		 189 aa  273  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  78.72 
 
 		 189 aa  272  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  70.43 
 
 		 190 aa  271  3e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  72.07 
 
 		 190 aa  271  4.0000000000000004e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  79.89 
 
 		 199 aa  255  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  63.93 
 
 		 186 aa  248  3e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  62.84 
 
 		 189 aa  240  7.999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 180 aa  232  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  58.56 
 
 		 193 aa  227  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  58.99 
 
 		 181 aa  225  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 191 aa  225  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  225  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 183 aa  224  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  223  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 180 aa  223  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 220 aa  223  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 180 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.19 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  58.15 
 
 		 186 aa  221  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  58.43 
 
 		 180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  220  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  220  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  220  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 183 aa  220  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 180 aa  219  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  56.57 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 182 aa  218  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 178 aa  218  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 192 aa  218  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  218  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 180 aa  218  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  217  7e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 180 aa  217  7.999999999999999e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>