More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0943 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  82.01 
 
 
191 aa  323  7e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  78.95 
 
 
189 aa  318  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  84.83 
 
 
192 aa  314  5e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  83.71 
 
 
199 aa  311  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  77.32 
 
 
194 aa  310  5.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  79.03 
 
 
189 aa  310  7.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  76.14 
 
 
198 aa  309  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  79.14 
 
 
189 aa  307  6.999999999999999e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  78.19 
 
 
192 aa  305  3e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  75.53 
 
 
191 aa  303  1.0000000000000001e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  75.79 
 
 
189 aa  301  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  77.72 
 
 
187 aa  301  4.0000000000000003e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  81.82 
 
 
189 aa  298  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  75.66 
 
 
190 aa  298  3e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  77.54 
 
 
188 aa  297  5e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  74.74 
 
 
191 aa  296  8e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  78.26 
 
 
187 aa  297  8e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  74.87 
 
 
193 aa  293  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  73.82 
 
 
191 aa  292  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  75.28 
 
 
196 aa  291  3e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  73.8 
 
 
193 aa  289  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  80.53 
 
 
189 aa  287  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  79.31 
 
 
184 aa  284  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  75.92 
 
 
192 aa  279  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  76.47 
 
 
189 aa  275  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  76.47 
 
 
189 aa  275  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  77.72 
 
 
187 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  77.72 
 
 
187 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  77.72 
 
 
187 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  77.72 
 
 
187 aa  270  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  75.94 
 
 
188 aa  268  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  75.66 
 
 
192 aa  268  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  75.54 
 
 
187 aa  266  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  64.55 
 
 
190 aa  264  5.999999999999999e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  76.77 
 
 
199 aa  263  8e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  65.08 
 
 
190 aa  263  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  74.74 
 
 
189 aa  262  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  67.61 
 
 
180 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  62.57 
 
 
183 aa  249  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  63.64 
 
 
180 aa  246  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  64.61 
 
 
186 aa  244  6.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 
180 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  62.37 
 
 
189 aa  242  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 
180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 
180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 
180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  63.64 
 
 
179 aa  241  7e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  240  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
178 aa  240  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  239  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
178 aa  239  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
220 aa  239  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  61.58 
 
 
179 aa  238  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  64.33 
 
 
179 aa  238  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  65.17 
 
 
183 aa  237  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.66 
 
 
180 aa  237  8e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
179 aa  237  9e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
179 aa  236  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  63.48 
 
 
180 aa  236  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  236  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
180 aa  235  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  235  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  62.43 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  62.43 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  62.43 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  62.43 
 
 
179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  62.43 
 
 
179 aa  234  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  234  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 
179 aa  234  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
187 aa  234  8e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  233  9e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  60.69 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  61.36 
 
 
191 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  61.63 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
178 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  60 
 
 
181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  64.2 
 
 
179 aa  232  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  60.12 
 
 
179 aa  231  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 
180 aa  232  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  61.05 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  61.27 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 
179 aa  231  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  61.27 
 
 
179 aa  231  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
179 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>