More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2963 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 193 aa  393  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  95.34 
 
 		 193 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  81.77 
 
 		 191 aa  320  7e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  80.1 
 
 		 190 aa  315  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  82.32 
 
 		 187 aa  313  9.999999999999999e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  80.83 
 
 		 191 aa  311  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  78.42 
 
 		 192 aa  309  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  80.54 
 
 		 189 aa  308  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  78.26 
 
 		 199 aa  305  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  75.26 
 
 		 189 aa  303  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  77.25 
 
 		 194 aa  301  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  79.01 
 
 		 189 aa  300  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  77.37 
 
 		 198 aa  298  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  78.02 
 
 		 192 aa  296  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  80.53 
 
 		 189 aa  294  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  74.19 
 
 		 188 aa  294  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  72.83 
 
 		 189 aa  292  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  73.8 
 
 		 190 aa  289  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 		 196 aa  288  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  72.92 
 
 		 191 aa  287  9e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  72.83 
 
 		 187 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  77.72 
 
 		 187 aa  277  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  72.73 
 
 		 190 aa  277  8e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  72.47 
 
 		 191 aa  274  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  76.8 
 
 		 188 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  76.63 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  76.63 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  76.63 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  75.29 
 
 		 184 aa  271  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  75.54 
 
 		 192 aa  270  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  75.26 
 
 		 189 aa  270  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  76.09 
 
 		 187 aa  269  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  74.74 
 
 		 189 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  70.59 
 
 		 190 aa  268  2.9999999999999997e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  75.54 
 
 		 189 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  75.84 
 
 		 189 aa  256  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  71.58 
 
 		 192 aa  254  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  65.38 
 
 		 186 aa  254  7e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  78.02 
 
 		 199 aa  252  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  65 
 
 		 189 aa  252  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 183 aa  240  1e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  62.15 
 
 		 181 aa  239  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 191 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  60.11 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  61.33 
 
 		 185 aa  237  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  61.33 
 
 		 185 aa  237  6.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 178 aa  235  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  62.36 
 
 		 180 aa  234  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  235  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 185 aa  235  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 178 aa  234  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  57.84 
 
 		 192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 180 aa  234  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  60.56 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 182 aa  232  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  59.67 
 
 		 193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  60.22 
 
 		 185 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 178 aa  231  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  56.67 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 180 aa  231  5e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 181 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 181 aa  231  7.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 180 aa  230  8.000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  230  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  230  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>