More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3715 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 180 aa  366  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  86.59 
 
 		 180 aa  322  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  86.59 
 
 		 180 aa  322  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  80.9 
 
 		 182 aa  311  2.9999999999999996e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  80.34 
 
 		 182 aa  309  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  81.56 
 
 		 181 aa  308  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  78.21 
 
 		 180 aa  301  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  76.7 
 
 		 179 aa  285  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 		 179 aa  280  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  73.71 
 
 		 179 aa  278  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  74.29 
 
 		 179 aa  277  7e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  69.32 
 
 		 179 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  69.32 
 
 		 179 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17281  50S ribosomal protein L5  69.54 
 
 		 178 aa  262  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.805696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  256  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 180 aa  255  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  255  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  63.28 
 
 		 179 aa  253  8e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 178 aa  252  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16661  50S ribosomal protein L5  72 
 
 		 179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 180 aa  251  4.0000000000000004e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 180 aa  249  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  248  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  247  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 223 aa  247  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 183 aa  247  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  65.56 
 
 		 184 aa  246  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 180 aa  244  6e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  244  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 186 aa  243  8e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17371  50S ribosomal protein L5  68.18 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17531  50S ribosomal protein L5  68.18 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 180 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1638  50S ribosomal protein L5  67.61 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 180 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 189 aa  241  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 180 aa  241  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 180 aa  240  7e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  240  7.999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  240  7.999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 182 aa  240  9e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  58.76 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 180 aa  240  9e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 191 aa  239  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  59.89 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3285  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 180 aa  238  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000500711  hitchhiker  0.00000237864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2938  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 180 aa  238  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00000312511  hitchhiker  0.000000922003 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  60.56 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 180 aa  237  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 181 aa  238  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 180 aa  237  6.999999999999999e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>