More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4303 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 189 aa  383  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  99.47 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  81.82 
 
 		 192 aa  317  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  79.14 
 
 		 188 aa  310  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  77.66 
 
 		 192 aa  305  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  80.95 
 
 		 189 aa  301  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  77.54 
 
 		 194 aa  298  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  76.06 
 
 		 189 aa  298  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  78.77 
 
 		 191 aa  297  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  75.79 
 
 		 191 aa  297  6e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  77.25 
 
 		 187 aa  296  8e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  77.42 
 
 		 191 aa  296  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  77.42 
 
 		 187 aa  296  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  74.6 
 
 		 189 aa  294  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  78.07 
 
 		 189 aa  293  9e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  76.47 
 
 		 190 aa  293  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  76.47 
 
 		 190 aa  293  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  72.49 
 
 		 191 aa  292  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  78.21 
 
 		 199 aa  291  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  77.35 
 
 		 193 aa  291  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  76.34 
 
 		 198 aa  290  7e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  75.26 
 
 		 193 aa  289  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  74.47 
 
 		 189 aa  288  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  71.96 
 
 		 196 aa  285  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  78.61 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  78.31 
 
 		 187 aa  280  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  76.72 
 
 		 189 aa  279  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  78.31 
 
 		 187 aa  278  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  78.31 
 
 		 187 aa  278  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  78.31 
 
 		 187 aa  278  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  78.19 
 
 		 189 aa  276  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  77.01 
 
 		 192 aa  276  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  77.3 
 
 		 187 aa  273  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  76.61 
 
 		 184 aa  270  1e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  75.68 
 
 		 192 aa  268  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  66.31 
 
 		 190 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  66.31 
 
 		 190 aa  263  8.999999999999999e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  76.38 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  63.59 
 
 		 186 aa  244  4.9999999999999997e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  63.89 
 
 		 180 aa  244  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  64.48 
 
 		 189 aa  237  9e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  66.11 
 
 		 183 aa  236  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 183 aa  235  3e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  63.48 
 
 		 181 aa  234  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 180 aa  234  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  63.54 
 
 		 193 aa  233  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 191 aa  230  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1172  ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 180 aa  230  1e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0444943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  62.92 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  58.33 
 
 		 182 aa  228  5e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  57.54 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 178 aa  224  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  56.42 
 
 		 179 aa  224  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 181 aa  223  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 179 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  59.44 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 180 aa  222  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 180 aa  222  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 178 aa  222  3e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>