More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1027 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  92.02 
 
 		 188 aa  352  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  85.03 
 
 		 187 aa  334  5e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  91.49 
 
 		 188 aa  323  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  83.7 
 
 		 192 aa  323  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  79.03 
 
 		 189 aa  313  7e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  86.1 
 
 		 192 aa  307  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  79.33 
 
 		 199 aa  307  5.9999999999999995e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  77.54 
 
 		 187 aa  307  6.999999999999999e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  86.1 
 
 		 187 aa  307  8e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  79.23 
 
 		 192 aa  302  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  79.21 
 
 		 191 aa  300  8.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  85.03 
 
 		 187 aa  300  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  75.96 
 
 		 194 aa  298  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  76.09 
 
 		 191 aa  297  5e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  74.73 
 
 		 189 aa  296  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  76.11 
 
 		 191 aa  295  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  80.65 
 
 		 189 aa  295  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  77.72 
 
 		 190 aa  295  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  76.63 
 
 		 193 aa  295  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  76.09 
 
 		 193 aa  293  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  73.66 
 
 		 189 aa  292  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  74.59 
 
 		 198 aa  291  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  76.67 
 
 		 196 aa  289  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  80.75 
 
 		 189 aa  288  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  74.86 
 
 		 190 aa  287  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  73.37 
 
 		 189 aa  286  9e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  73.18 
 
 		 191 aa  286  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  82.12 
 
 		 192 aa  286  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  78.31 
 
 		 189 aa  283  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  78.31 
 
 		 189 aa  283  9e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  77.78 
 
 		 184 aa  280  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  80.85 
 
 		 189 aa  278  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  84.62 
 
 		 199 aa  272  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 190 aa  265  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  69.27 
 
 		 190 aa  264  5e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  65.03 
 
 		 186 aa  258  5.0000000000000005e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  68.93 
 
 		 189 aa  251  5.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  61.11 
 
 		 180 aa  242  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 183 aa  240  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 178 aa  239  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 178 aa  239  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 180 aa  237  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  60.77 
 
 		 193 aa  235  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  62.22 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 191 aa  234  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  61.33 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  61.33 
 
 		 185 aa  231  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  57.78 
 
 		 180 aa  231  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 197 aa  231  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  61.88 
 
 		 185 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 182 aa  229  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 182 aa  229  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  61.24 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 178 aa  228  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 193 aa  228  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  58.51 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  58.51 
 
 		 188 aa  228  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  58.56 
 
 		 193 aa  227  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  56.98 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 179 aa  227  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 178 aa  227  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 187 aa  226  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  57.87 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 185 aa  226  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  57.45 
 
 		 188 aa  225  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 180 aa  225  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>