More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1719 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  89.47 
 
 		 190 aa  357  4e-98  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  70 
 
 		 190 aa  281  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  70.37 
 
 		 191 aa  279  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  69.73 
 
 		 191 aa  278  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  70.21 
 
 		 198 aa  278  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  70.43 
 
 		 187 aa  277  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  72.73 
 
 		 193 aa  277  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  68.45 
 
 		 199 aa  275  4e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  71.66 
 
 		 193 aa  274  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  66.84 
 
 		 189 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  70.05 
 
 		 188 aa  271  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 189 aa  269  2e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  67.2 
 
 		 189 aa  268  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  67.88 
 
 		 192 aa  266  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  67.37 
 
 		 191 aa  266  1e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  64.55 
 
 		 190 aa  264  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  66.84 
 
 		 194 aa  264  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 196 aa  263  8e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  71.66 
 
 		 187 aa  263  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  67.37 
 
 		 189 aa  262  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  70.05 
 
 		 189 aa  261  4.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  66.3 
 
 		 191 aa  261  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 192 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  66.31 
 
 		 189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  67.89 
 
 		 192 aa  252  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  70.43 
 
 		 187 aa  252  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  71.51 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  65.78 
 
 		 189 aa  251  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  64.52 
 
 		 187 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  70.05 
 
 		 188 aa  250  7e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  67.65 
 
 		 184 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  67.74 
 
 		 189 aa  245  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 187 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 187 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  71.51 
 
 		 187 aa  245  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  66.84 
 
 		 192 aa  237  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  62.36 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  61.45 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  60.56 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 189 aa  224  6e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  55.56 
 
 		 220 aa  222  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0779  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 183 aa  221  4e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000663663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 180 aa  221  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  59.44 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  56.68 
 
 		 186 aa  218  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 182 aa  218  6e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 187 aa  217  7e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  56.67 
 
 		 186 aa  217  7e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 180 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0613  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  217  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 191 aa  217  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0393  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00978346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  56.4 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0385  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000000334346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2313  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  215  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000920139  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  58.01 
 
 		 182 aa  214  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 183 aa  214  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  214  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  54.65 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 180 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 183 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  57.46 
 
 		 185 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0185  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 181 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2944 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 179 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 178 aa  212  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  51.4 
 
 		 180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 178 aa  211  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  55.93 
 
 		 193 aa  211  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 180 aa  211  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  51.11 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  56.91 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 180 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4355  50S ribosomal protein L5  55.06 
 
 		 184 aa  211  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000045958  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 		 179 aa  210  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  54.65 
 
 		 179 aa  210  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 180 aa  210  9e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  51.63 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 180 aa  210  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  54.8 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 180 aa  209  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>