More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0594 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0594  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6037  50S ribosomal protein L5  90.45 
 
 		 189 aa  326  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138153 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  85.16 
 
 		 192 aa  322  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  80.54 
 
 		 189 aa  313  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  81.42 
 
 		 188 aa  311  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  73.87 
 
 		 199 aa  311  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  77.04 
 
 		 196 aa  310  6.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  82.12 
 
 		 187 aa  309  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  74.37 
 
 		 191 aa  308  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  83.15 
 
 		 190 aa  306  9e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  79.23 
 
 		 191 aa  305  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  72.73 
 
 		 189 aa  304  6e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  82.02 
 
 		 192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0700  ribosomal protein L5  79.4 
 
 		 189 aa  301  4.0000000000000003e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  78.77 
 
 		 187 aa  300  7.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  76.92 
 
 		 189 aa  298  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  77.65 
 
 		 191 aa  297  6e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  76.8 
 
 		 194 aa  297  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  75.82 
 
 		 198 aa  297  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  76.22 
 
 		 190 aa  296  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  76.24 
 
 		 189 aa  294  5e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  78.02 
 
 		 193 aa  294  6e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1056  50S ribosomal protein L5  84.62 
 
 		 187 aa  293  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000356409  normal  0.261922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1027  50S ribosomal protein L5  84.62 
 
 		 187 aa  293  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000321161  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1044  50S ribosomal protein L5  84.62 
 
 		 187 aa  293  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000979581  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5136  ribosomal protein L5  70.2 
 
 		 191 aa  293  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.429386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  77.53 
 
 		 193 aa  291  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3911  50S ribosomal protein L5  76.38 
 
 		 189 aa  286  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.312917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4303  50S ribosomal protein L5  76.38 
 
 		 189 aa  286  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.434837  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1135  ribosomal protein L5  81.42 
 
 		 192 aa  284  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.738574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5035  50S ribosomal protein L5  80.87 
 
 		 188 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000622365  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  78.36 
 
 		 184 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3711  ribosomal protein L5  82.12 
 
 		 192 aa  279  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6602  ribosomal protein L5  82.78 
 
 		 187 aa  278  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3419  ribosomal protein L5  79.89 
 
 		 187 aa  272  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04100  LSU ribosomal protein L5P  78.33 
 
 		 189 aa  263  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  69.27 
 
 		 190 aa  263  1e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1719  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 190 aa  261  6e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  64.04 
 
 		 183 aa  254  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  67.04 
 
 		 186 aa  254  8e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 180 aa  251  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  68.16 
 
 		 189 aa  250  8.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 191 aa  248  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  62.92 
 
 		 180 aa  245  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 179 aa  244  4.9999999999999997e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 180 aa  243  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.67 
 
 		 180 aa  241  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  7e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  241  7e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2166  ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0216676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09880  LSU ribosomal protein L5P  64.61 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00169364  hitchhiker  0.0000180186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  63.48 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  60.89 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 178 aa  238  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  63.19 
 
 		 185 aa  238  5.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  63.19 
 
 		 185 aa  238  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 181 aa  238  5.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 178 aa  237  9e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 182 aa  236  2e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 193 aa  235  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>