More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0434 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
179 aa  362  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  79.89 
 
 
181 aa  306  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  76.4 
 
 
180 aa  296  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  79.33 
 
 
180 aa  290  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 
179 aa  286  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 
179 aa  286  9e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 
179 aa  286  9e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  74.86 
 
 
179 aa  286  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  74.3 
 
 
179 aa  286  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  73.74 
 
 
179 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  73.18 
 
 
179 aa  286  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  74.3 
 
 
179 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  74.3 
 
 
179 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  73.74 
 
 
179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  73.74 
 
 
179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  73.74 
 
 
179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  73.74 
 
 
179 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  74.16 
 
 
180 aa  279  1e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  72.63 
 
 
179 aa  279  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  71.51 
 
 
179 aa  278  2e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  72.07 
 
 
180 aa  278  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  70.95 
 
 
179 aa  277  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  70.95 
 
 
179 aa  277  6e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  68.93 
 
 
180 aa  276  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  71.59 
 
 
183 aa  274  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  70.79 
 
 
178 aa  274  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  70.39 
 
 
179 aa  274  6e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  70.95 
 
 
182 aa  273  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  70.29 
 
 
180 aa  271  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  69.49 
 
 
180 aa  269  2e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  70.62 
 
 
179 aa  268  5e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  70.62 
 
 
179 aa  268  5e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  70.39 
 
 
179 aa  267  5.9999999999999995e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  263  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
180 aa  263  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 
179 aa  263  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  262  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 
180 aa  262  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  67.04 
 
 
179 aa  261  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 
180 aa  261  4.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 
180 aa  260  6e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
180 aa  259  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  67.98 
 
 
179 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
180 aa  259  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  68.18 
 
 
180 aa  259  2e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
220 aa  257  6e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  65.91 
 
 
180 aa  257  6e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  65.73 
 
 
179 aa  257  7e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  64.04 
 
 
179 aa  254  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  253  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  64.97 
 
 
179 aa  253  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
184 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  65.92 
 
 
184 aa  251  6e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 
181 aa  250  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  64.97 
 
 
191 aa  249  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3326  50S ribosomal protein L5  62.92 
 
 
179 aa  248  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000159394  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 
180 aa  248  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 
180 aa  248  3e-65  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 
180 aa  248  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  64 
 
 
193 aa  248  4e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
182 aa  247  5e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  64.25 
 
 
185 aa  247  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  65.17 
 
 
180 aa  247  7e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
179 aa  246  8e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  63.84 
 
 
181 aa  246  9e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
180 aa  246  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 
179 aa  246  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 
192 aa  246  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
182 aa  245  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 
179 aa  245  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 
179 aa  245  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  65.34 
 
 
191 aa  244  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 
179 aa  244  6e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 
180 aa  243  9e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0339  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
180 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0509  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
180 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0543565  hitchhiker  0.000000000388642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
180 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
180 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
180 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  61.8 
 
 
179 aa  243  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  62.36 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1197  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
192 aa  242  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0484723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1173  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
180 aa  241  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00494805  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  62.15 
 
 
186 aa  241  3.9999999999999997e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  57.54 
 
 
179 aa  241  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  60.34 
 
 
179 aa  240  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
180 aa  240  6e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  61.45 
 
 
185 aa  240  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 
179 aa  240  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 
179 aa  240  7e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 
179 aa  240  7e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
180 aa  240  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 
179 aa  240  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1172  ribosomal protein L5  62.71 
 
 
180 aa  240  7.999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0444943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  63.28 
 
 
190 aa  240  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>