More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2220 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 179 aa  360  5.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  77.4 
 
 		 182 aa  295  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  75.71 
 
 		 182 aa  292  1e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  77.27 
 
 		 180 aa  289  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  75.98 
 
 		 179 aa  286  7e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  74.3 
 
 		 179 aa  286  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  76.57 
 
 		 180 aa  286  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  76.57 
 
 		 180 aa  286  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 		 181 aa  285  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  76.7 
 
 		 180 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 		 179 aa  284  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  74.16 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  74.16 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17281  50S ribosomal protein L5  72.16 
 
 		 178 aa  275  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.805696  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16661  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 		 179 aa  264  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17531  50S ribosomal protein L5  72.63 
 
 		 179 aa  258  4e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17371  50S ribosomal protein L5  72.63 
 
 		 179 aa  257  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1638  50S ribosomal protein L5  72.07 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  64.57 
 
 		 183 aa  249  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  63.74 
 
 		 179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  61.49 
 
 		 180 aa  241  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  238  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  63.22 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  236  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  61.4 
 
 		 179 aa  235  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  62.64 
 
 		 191 aa  234  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 180 aa  234  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  60.92 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 178 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 182 aa  231  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 		 180 aa  231  5e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 220 aa  231  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 184 aa  229  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  64 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  57.95 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  56.82 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 223 aa  228  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  54.49 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  227  7e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  59.06 
 
 		 179 aa  227  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 		 196 aa  226  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  58.48 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 189 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  225  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  51.41 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  224  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1173  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 180 aa  224  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00494805  normal  0.187768 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  224  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>