More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2607 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  86.26 
 
 
182 aa  328  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  71.19 
 
 
179 aa  277  5e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  65.14 
 
 
183 aa  244  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 
179 aa  244  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
180 aa  244  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  62.64 
 
 
180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 
179 aa  240  9e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 
180 aa  239  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  62.5 
 
 
179 aa  237  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  237  9e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
179 aa  235  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
179 aa  234  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  64.37 
 
 
191 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 
189 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  234  7e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
182 aa  234  8e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  233  8e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  61.36 
 
 
190 aa  233  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
180 aa  231  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  232  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 
182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  60.8 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  231  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
179 aa  231  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.02 
 
 
180 aa  231  6e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  59.12 
 
 
190 aa  230  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 
182 aa  230  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  230  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
179 aa  230  9e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
180 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  230  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 
179 aa  230  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 
179 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
180 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17281  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
178 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.805696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
180 aa  228  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
180 aa  228  2e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
180 aa  228  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
193 aa  229  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  59.66 
 
 
193 aa  229  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
184 aa  229  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
180 aa  228  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  59.2 
 
 
179 aa  228  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1126  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 
184 aa  228  4e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0974998  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
179 aa  228  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 
179 aa  228  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 
187 aa  228  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
180 aa  227  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  61.14 
 
 
191 aa  227  7e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
194 aa  227  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 
179 aa  227  7e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  59.66 
 
 
189 aa  226  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  60 
 
 
179 aa  225  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  225  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 
180 aa  226  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  59.67 
 
 
191 aa  226  2e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  225  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  59.09 
 
 
192 aa  225  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0335  ribosomal protein L5  55.11 
 
 
179 aa  225  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000680284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
179 aa  226  2e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  60.23 
 
 
187 aa  225  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  225  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  225  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  225  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  225  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 
179 aa  225  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  58.62 
 
 
179 aa  225  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 
178 aa  225  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  225  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10730  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
187 aa  224  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.443484 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
180 aa  224  4e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
198 aa  224  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  224  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
179 aa  224  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  224  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  60.23 
 
 
189 aa  224  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
179 aa  224  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  224  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  60 
 
 
179 aa  224  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  223  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
179 aa  223  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 
179 aa  223  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  223  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  59.66 
 
 
189 aa  223  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  223  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 
179 aa  223  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  59.66 
 
 
189 aa  223  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 
179 aa  223  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  57.39 
 
 
179 aa  223  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 
179 aa  223  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  61.18 
 
 
184 aa  223  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1334  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
188 aa  223  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000410283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>