More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1126 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1126  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0974998  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  79.01 
 
 		 182 aa  310  7.999999999999999e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  75.96 
 
 		 184 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  75.96 
 
 		 193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0778  50S ribosomal protein L5  66.3 
 
 		 185 aa  265  2.9999999999999995e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.807556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  65.91 
 
 		 179 aa  246  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 179 aa  243  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.2 
 
 		 183 aa  238  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.2 
 
 		 180 aa  228  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 182 aa  228  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  57.69 
 
 		 193 aa  226  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  224  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  223  9e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 180 aa  223  9e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 189 aa  223  9e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 198 aa  223  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 191 aa  222  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 181 aa  222  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 		 180 aa  222  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 180 aa  221  4e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  58.05 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  221  6e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2675  50S ribosomal protein L5  55.98 
 
 		 193 aa  220  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2963  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318633  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  56 
 
 		 180 aa  218  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  56 
 
 		 180 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  56 
 
 		 180 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 182 aa  218  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17281  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.805696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  217  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  55.68 
 
 		 192 aa  217  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  216  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  54.91 
 
 		 184 aa  216  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 189 aa  216  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0318  50S ribosomal protein L5  52.78 
 
 		 196 aa  216  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374414 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 191 aa  216  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  52.75 
 
 		 192 aa  215  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  215  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 		 178 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  50.84 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  56.57 
 
 		 191 aa  215  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1098  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 194 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0564211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0599  ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 187 aa  214  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.975222  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 182 aa  214  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  52.27 
 
 		 179 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 180 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2647  ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 190 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3131  ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 179 aa  213  9e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29620  LSU ribosomal protein L5P  52.84 
 
 		 189 aa  213  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.787751 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23680  LSU ribosomal protein L5P  55.11 
 
 		 189 aa  213  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0282632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 180 aa  211  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0943  ribosomal protein L5  51.7 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  54.86 
 
 		 179 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0410  ribosomal protein L5  51.98 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  54.86 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  211  4.9999999999999996e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  54.55 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0264  ribosomal L5P C-terminal domain protein  55.68 
 
 		 190 aa  210  7.999999999999999e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  210  9e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>