More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0778 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0778  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.807556  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1304  50S ribosomal protein L5  67.58 
 
 		 193 aa  276  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000240969  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1382  50S ribosomal protein L5  67.58 
 
 		 184 aa  276  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00212588  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1126  50S ribosomal protein L5  66.3 
 
 		 184 aa  265  2.9999999999999995e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0974998  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0965  50S ribosomal protein L5  67.03 
 
 		 182 aa  264  5e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.190105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  222  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  57.46 
 
 		 183 aa  222  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  221  7e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  219  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  218  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 180 aa  217  7.999999999999999e-56  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 179 aa  217  7.999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 180 aa  217  7.999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  56.74 
 
 		 193 aa  216  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  55.8 
 
 		 191 aa  216  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 		 180 aa  214  5e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3893  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 198 aa  214  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  57.39 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 189 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 179 aa  211  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  211  5.999999999999999e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 182 aa  211  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  210  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  55.75 
 
 		 180 aa  209  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  210  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  55.62 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 180 aa  208  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 		 180 aa  208  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  54.29 
 
 		 180 aa  208  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  54.24 
 
 		 180 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  54.55 
 
 		 179 aa  208  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  56.25 
 
 		 180 aa  207  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 191 aa  207  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 179 aa  207  6e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  55.43 
 
 		 179 aa  207  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  207  7e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 182 aa  207  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  54.86 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  55.68 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2245  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00560978  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  53.37 
 
 		 192 aa  206  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1765  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 181 aa  206  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00103364  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  52.81 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2895  ribosomal protein L5  53.93 
 
 		 182 aa  205  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  54.55 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  53.41 
 
 		 179 aa  205  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  53.14 
 
 		 179 aa  205  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 179 aa  204  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4309  ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 189 aa  204  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.183927  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1021  50S ribosomal protein L5  55.11 
 
 		 181 aa  204  5e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000164451  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  54.19 
 
 		 193 aa  204  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 		 196 aa  204  6e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4495  ribosomal protein L5  55.29 
 
 		 184 aa  204  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  204  8e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 180 aa  204  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  204  8e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  203  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  203  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  50.85 
 
 		 182 aa  204  9e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  53.41 
 
 		 179 aa  203  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  51.96 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  53.98 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  52.54 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  53.11 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  52.84 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  52.46 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  53.71 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  52.27 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  53.67 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>