More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2052 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2052  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000691649  normal  0.426198 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2284  50S ribosomal protein L5  84.18 
 
 		 196 aa  344  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000542096  hitchhiker  0.00336631 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2217  50S ribosomal protein L5  82.14 
 
 		 195 aa  328  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286629  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2411  50S ribosomal protein L5  85.08 
 
 		 195 aa  322  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000885731  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0301  50S ribosomal protein L5  82.97 
 
 		 195 aa  317  7.999999999999999e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.433186  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1839  50S ribosomal protein L5  80.77 
 
 		 195 aa  312  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0193  50S ribosomal protein L5  81.11 
 
 		 194 aa  310  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.368513  normal  0.701941 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  65 
 
 		 191 aa  249  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  63.13 
 
 		 179 aa  240  7.999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 184 aa  238  4e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  237  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  237  9e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 178 aa  236  2e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 180 aa  235  4e-61  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  58.1 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  59.78 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3632  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000391784  decreased coverage  0.00000000000159528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0326  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000464858  decreased coverage  0.00283063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2827  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000925898  normal  0.276949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  59.22 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  61.24 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 180 aa  234  6e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 179 aa  233  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2620  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0483122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  58.99 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0288  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152111  normal  0.01295 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1936  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000916993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3764  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0003555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3157  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000127372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3490  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3056  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000258896  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3792  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0743065  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  57.54 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3734  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000331998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0279  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000228598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0261  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00011988  hitchhiker  0.00419611 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3459  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000529438  decreased coverage  0.00459021 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0339  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000790094  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2747  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000000541719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0574  50S ribosomal protein L5  61.45 
 
 		 189 aa  232  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0360  50S ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000501329  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2634  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 		 191 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.043764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  231  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05780  ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 183 aa  230  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 180 aa  230  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1172  ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0444943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  56.98 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 180 aa  229  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  56.98 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  228  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0859  50S ribosomal protein L5  57.22 
 
 		 185 aa  228  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246885  hitchhiker  0.001984 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  56.04 
 
 		 182 aa  228  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3983  ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 		 179 aa  228  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04509  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00526127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  56.82 
 
 		 180 aa  228  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3431  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 184 aa  228  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00979614  normal  0.204364 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 181 aa  228  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  58.43 
 
 		 179 aa  228  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0768  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 		 180 aa  228  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0251429  normal  0.0345896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 180 aa  227  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  57.87 
 
 		 180 aa  227  7e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  56.18 
 
 		 179 aa  227  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  55.31 
 
 		 179 aa  227  9e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  56.42 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 179 aa  226  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3305  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  226  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000419375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0639  ribosomal protein L5  56.91 
 
 		 191 aa  226  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.103103  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 		 183 aa  226  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  56.11 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  54.75 
 
 		 179 aa  226  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17040  LSU ribosomal protein L5P  59.66 
 
 		 191 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000390944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>