More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1967 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1967  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  96.09 
 
 		 179 aa  351  2.9999999999999997e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  89.39 
 
 		 179 aa  337  8e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1117  50S ribosomal protein L5  83.05 
 
 		 179 aa  314  5e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19911  50S ribosomal protein L5  82.49 
 
 		 179 aa  313  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17281  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 		 178 aa  301  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.805696  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16661  50S ribosomal protein L5  82.68 
 
 		 179 aa  293  7e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1638  50S ribosomal protein L5  79.89 
 
 		 179 aa  290  6e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17371  50S ribosomal protein L5  79.33 
 
 		 179 aa  289  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17531  50S ribosomal protein L5  78.77 
 
 		 179 aa  288  3e-77  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  74.01 
 
 		 182 aa  284  5.999999999999999e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2220  50S ribosomal protein L5  75.42 
 
 		 179 aa  284  5.999999999999999e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  73.86 
 
 		 180 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  73.86 
 
 		 180 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  73.6 
 
 		 181 aa  282  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  73.45 
 
 		 182 aa  280  1e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  73.71 
 
 		 180 aa  278  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  73.14 
 
 		 180 aa  271  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  248  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  247  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  244  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 183 aa  242  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4536  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.322286  normal  0.125258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 180 aa  239  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0638  ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000106157  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0466  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.224995  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0496  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0116294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0499  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228142  normal  0.104863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  63.22 
 
 		 184 aa  238  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  237  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 178 aa  236  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  59.43 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  61.49 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 180 aa  234  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  57.95 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2607  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 182 aa  233  8e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000613532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4926  ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000138257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  60.92 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  58.86 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0349  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000265195  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1842  50S ribosomal protein L5  58.66 
 
 		 182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0854  ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 191 aa  231  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 		 180 aa  231  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 180 aa  231  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 		 179 aa  230  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  230  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 220 aa  230  8.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>