More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0373 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0373  50S ribosomal protein L5  100 
 
 		 186 aa  383  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.924655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1727  50S ribosomal protein L5  99.46 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.208294  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2522  50S ribosomal protein L5  94.62 
 
 		 186 aa  367  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0771  50S ribosomal protein L5  87.1 
 
 		 186 aa  340  9e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.542997  normal  0.855844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0297  50S ribosomal protein L5  82.35 
 
 		 187 aa  322  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.882379 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0266  50S ribosomal protein L5  74.87 
 
 		 187 aa  293  7e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0642331  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0603  50S ribosomal protein L5  75.68 
 
 		 186 aa  293  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1626  50S ribosomal protein L5  68.82 
 
 		 185 aa  275  3e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317826  normal  0.302656 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1783  50S ribosomal protein L5  69.35 
 
 		 186 aa  275  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0286744  normal  0.0861525 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0568  ribosomal protein L5  67.6 
 
 		 243 aa  270  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1221  50S ribosomal protein L5  70.45 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0710  50S ribosomal protein L5  68.54 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00257527  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1184  50S ribosomal protein L5  70.45 
 
 		 185 aa  266  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.161581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1666  50S ribosomal protein L5  66.3 
 
 		 185 aa  266  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2748  ribosomal protein L5  67.4 
 
 		 185 aa  265  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0213845  normal  0.1254 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1366  ribosomal protein L5  68.16 
 
 		 197 aa  265  4e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477125  normal  0.036425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  67.42 
 
 		 188 aa  263  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  66.48 
 
 		 192 aa  263  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1968  50S ribosomal protein L5  69.32 
 
 		 185 aa  262  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0033895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 		 188 aa  262  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4786  50S ribosomal protein L5  64.48 
 
 		 185 aa  261  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00000888457  hitchhiker  0.00000000734495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1853  50S ribosomal protein L5  68.51 
 
 		 185 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2206  50S ribosomal protein L5  64.84 
 
 		 188 aa  258  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  67.04 
 
 		 193 aa  259  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5058  50S ribosomal protein L5  63.54 
 
 		 185 aa  256  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1376  50S ribosomal protein L5  61.88 
 
 		 185 aa  254  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2307  50S ribosomal protein L5  62.98 
 
 		 185 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0101823  normal  0.115344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3655  50S ribosomal protein L5  62.43 
 
 		 185 aa  254  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1934  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 185 aa  253  8e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.562319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2978  50S ribosomal protein L5  64.67 
 
 		 189 aa  253  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1442  50S ribosomal protein L5  65.57 
 
 		 185 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  65.73 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2152  50S ribosomal protein L5  63.19 
 
 		 188 aa  252  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.823556 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0998  50S ribosomal protein L5  67.4 
 
 		 185 aa  252  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0178085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1344  50S ribosomal protein L5  66.12 
 
 		 185 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000471517  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2467  50S ribosomal protein L5  62.09 
 
 		 188 aa  249  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.246254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2189  50S ribosomal protein L5  62.09 
 
 		 188 aa  249  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3172  50S ribosomal protein L5  59.12 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.978745 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1557  50S ribosomal protein L5  60.22 
 
 		 185 aa  247  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3436  50S ribosomal protein L5  59.67 
 
 		 185 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160205  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 179 aa  245  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  64 
 
 		 179 aa  244  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  241  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 186 aa  242  3e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  237  6.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  237  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1159  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000883476  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  61.49 
 
 		 180 aa  235  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  234  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  61.49 
 
 		 179 aa  234  5.0000000000000005e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0385  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  59.43 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  57.71 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  234  7e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 180 aa  234  7e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 		 182 aa  234  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  234  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  60.67 
 
 		 183 aa  233  9e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 		 180 aa  233  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  60 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.86 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  61.14 
 
 		 180 aa  232  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  59.77 
 
 		 179 aa  232  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3937  50S ribosomal protein L5  61.71 
 
 		 183 aa  231  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  60.89 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5058  ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0491308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  58.29 
 
 		 179 aa  231  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>